四川PNGaseF去糖基化酶蛋白質(zhì)組學(xué)研究

經(jīng)過多年的經(jīng)驗(yàn)積累及市場積淀，倍篤生物已組合多條不同產(chǎn)品線，分別滿足體外診斷、organoid及干細(xì)胞、細(xì)胞基因藥物等領(lǐng)域的需求。其中，細(xì)胞基因藥物領(lǐng)域產(chǎn)品線包含SAN HQ高鹽核酸酶及M-SAN HQ中鹽核酸酶、泊洛沙姆P 188 Bio、GMP級MSC/PSC培養(yǎng)基、GMP級膠原酶、AAV滴度檢測產(chǎn)品、工藝雜質(zhì)及外源污染物殘留檢測產(chǎn)品、聚糖分析用酶、ADC偶聯(lián)技術(shù)、QED抗體對、AAV中和抗體、蛋白酶等；相關(guān)品牌有挪威ArcticZymes Technologies、德國BASF、德國Sartorius、德國Nordmark、瑞典Genovis、美國QED、中國君研生物等。OpeRATOR 是一種 O-聚糖特異性蛋白酶，可消化攜帶he心 1 O-聚糖的蛋白質(zhì)，糖基化（he心 1）Ser 和 Thr 殘基的 N 端。四川PNGaseF去糖基化酶蛋白質(zhì)組學(xué)研究

為了研究 OglyZOR 對天然糖蛋白的活性，將該酶與依那西普、TNFR 和阿巴西普在 37°C 下有或沒有 SialEXO 孵育 1 小時(shí)。當(dāng)唾液酸被去除時(shí)，OglyZOR酶有效地水解了所有三種底物中的O-聚糖。Genovis的OglyZOR 酶可有效水解天然糖蛋白中的he心 1 二糖 （Gal-β1,3-GalNAc）。這使得這些酶適合在LC-MS分析之前制備樣品，以鑒定其他PTM或確認(rèn)氨基酸序列O-糖基化生物制藥的全去糖基化：O-糖基化生物制藥（如依那西普）很難表征。為了能夠通過質(zhì)譜法測定完整質(zhì)量數(shù)，我們進(jìn)行了酶促總?cè)ヌ腔?。N-聚糖被Genovis的PNGase F裂解，而O-聚糖可以與OglyZOR和SialEXO一起去除。。河南用于自動化系統(tǒng)的96孔板形式PNGaseF去糖基化酶疾病機(jī)理研究ImpaRATOR? 可用于多種 O-聚糖結(jié)構(gòu)表征。

Fc N-聚糖在抗體的效應(yīng)功能中起著至關(guān)重要的作用，但可能會增加蛋白質(zhì)表征測定的復(fù)雜性。在天然條件下用PNGase F去除Fc N-糖可以表征游離N-糖以及去糖基化抗體的功能和結(jié)構(gòu)。 為了證明PNGase F固定化和PNGase F凍干在天然反應(yīng)條件下有效去除Fc N-聚糖，對zhiliao性抗體曲妥珠單抗進(jìn)行了處理。圖2中的質(zhì)量數(shù)偏移表明，在37°C下用Genovis的PNGase F凍干或PNGase F固定化孵育1小時(shí)后，曲妥珠單抗上的Fc N-聚糖成功去除，與在溶液中用PNGase F凍干處理的樣品相比，沒有酶干擾用PNGase F固定處理的樣品的分析。

Genovis的PNGase F 是一種糖酰胺酶，可水解多肽天冬酰胺與所有哺乳動物天冬酰胺連接復(fù)合物、雜交體或高甘露糖寡糖的內(nèi)層 GlcNAc 之間的酰胺鍵。 在反應(yīng)過程中，從中去除聚糖的天冬酰胺殘基被脫酰胺為天冬氨酸。釋放的低聚糖完好無損，可用于進(jìn)一步分析。N-糖的去除被用于MS分析的樣品制備，以降低蛋白質(zhì)的異質(zhì)性，使游離的糖分析成為可能，并研究N-糖的功能作用。 該酶在大腸桿菌中表達(dá)，該重組基因來源于伊麗莎白金氏腦膜敗血癥。 評價(jià)抗體片段對完整蛋白聚集的影響。 IgG1 mAb1和mAb2在Biogen生產(chǎn)。 mAb1被糖基化，主要的糖型是具有0和1半乳糖的he心聚焦雙觸角聚糖(FA2和FA2G1); mAb2被糖基化。PNGase F是一種非常成熟的工具。O-糖的去除可能更具挑戰(zhàn)性，現(xiàn)有的O-糖釋放化學(xué)方法不太適合下游分析。

Genovis的SialEXO固定化用于復(fù)雜糖蛋白的去唾液酸化：在設(shè)置反應(yīng)條件時(shí)，需要在所需的反應(yīng)時(shí)間和完成反應(yīng)所需的酶量之間進(jìn)行權(quán)衡。較高的酶量可保證在更短的時(shí)間內(nèi)完成周轉(zhuǎn)，但會使下游分析復(fù)雜化。為了避免此類問題，我們以離心柱形式固定了活性SialEXO。這允許以更短的孵育時(shí)間孵育具有明顯更高量的唾液酸酶的糖蛋白底物。Genovis測試了 SialEXO 凍干和 SialEXO 固定化在人 C1 抑制劑上的性能。這種糖蛋白是一種具有挑戰(zhàn)性的底物，具有 6 個(gè) N- 和多達(dá) 26 個(gè) O-聚糖，由 α2,3 和 α2,6 連接的唾液酸修飾。對游離的N-聚糖的分析表明，SialEXO在溶液中完全脫唾液酸化，SialEXO固定化。使用 GalNAcEXO 對 O-糖基化生物制藥進(jìn)行 Tn 抗原表征。黑龍江瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶糖生物學(xué)研究

唾液酸的去除有助于研究蛋白質(zhì)中的潛在變體。SialEXO酶可在電荷異構(gòu)體分析之前去除所有唾液酸。四川PNGaseF去糖基化酶蛋白質(zhì)組學(xué)研究

在這里，Genovis分析了 C1 抑制劑——一種人血漿衍生的生物zhiliao藥物，由 6 種 N-聚糖和多達(dá) 28 種 O-聚糖修飾，主要由唾液酸he心 1 結(jié)構(gòu)組成。在不對這種高度異質(zhì)的蛋白質(zhì)進(jìn)行任何預(yù)處理的情況下，反相LC-MS分析產(chǎn)生了無法詳細(xì)解釋的復(fù)雜質(zhì)譜圖。在天然條件下使用OmniGLYZOR Microspin色譜柱，可在3小時(shí)內(nèi)有效去除所有O-聚糖。然而，蛋白質(zhì)上仍殘留著 1 到 3 個(gè) N-聚糖。使用凍干的PNGase F和OmniGLYZOR試劑盒中包含的MS友好型RapiGest? SF表面活性劑*，在變性條件下通過額外的去糖基化步驟去除這些不可接近的N-聚糖。觀察到所有聚糖的完全去除，但分子上存在的少量he心 2 O-聚糖除外。水解O-聚糖的酶不會從變性中獲益，這就是為什么OmniGLYZOR Microspin色譜柱只能在非變性條件下使用的原因。四川PNGaseF去糖基化酶蛋白質(zhì)組學(xué)研究