湖北N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白質組學研究

我們測量了FucosEXO從一組dai表不同鍵的不同寡糖底物中釋放的巖藻糖。FucosEXO可有效釋放α1-2、α1-3和α1-4連接的巖藻糖，對α1-6連接的巖藻糖殘基沒有活Genovis的FucosEXO的底物特異性：巖藻糖以不同的鍵存在于N-和O-聚糖上。α1-2、α1-3 和 α1-4 連接的巖藻糖常見于 O-聚糖中，并作為 N-聚糖的天線巖藻糖基化，而 α1-6 連接的巖藻糖被發(fā)現是 N-聚糖he心的修飾。β1-3,4半乳糖的水解：Genovis的GalactEXO 是一種β-半乳糖苷酶混合物，可水解 N-和 O-糖基化蛋白中的 β1-3,4-連接末端半乳糖。上海倍篤生物涵蓋藥物研發(fā)的全流程，抗體結構域分析蛋白酶、蛋白聚糖分析水解酶等。湖北N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白質組學研究

C1抑制劑的去糖基化：在O-糖基化生物制藥的生產過程中，由于he心GalNAc殘基的加工不完全，可能會出現Tn抗原。這表現為具有 203 Da HexNAc 單位差異的重復質量位移。為了確認 Tn 抗原的存在，可以應用以下工作流程，此處在重度（26 個位點）O-糖基化 C1 抑制劑上演示。首先，使用PNGaseF修剪糖蛋白的N-糖，使用Genovis的OglyZOR和SialEXO修剪he心1 O-糖。依那西普的磷性能測試?：依那西普是另一種具有挑戰(zhàn)性的生物制藥模型分子，攜帶 13 個 O-聚糖位點，其中平均 9 至 10 個位點被占用。山東N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶疾病機理研究與絲氨酸或蘇氨酸連接的 GalNAc（稱為 Tn 抗原）被 GalNAcEXO 快速有效地水解。

為了研究 OglyZOR 對天然糖蛋白的活性，將該酶與依那西普、TNFR 和阿巴西普在 37°C 下有或沒有 SialEXO 孵育 1 小時。當唾液酸被去除時，OglyZOR酶有效地水解了所有三種底物中的O-聚糖。Genovis的OglyZOR 酶可有效水解天然糖蛋白中的he心 1 二糖 （Gal-β1,3-GalNAc）。這使得這些酶適合在LC-MS分析之前制備樣品，以鑒定其他PTM或確認氨基酸序列O-糖基化生物制藥的全去糖基化：O-糖基化生物制藥（如依那西普）很難表征。為了能夠通過質譜法測定完整質量數，我們進行了酶促總去糖基化。N-聚糖被Genovis的PNGase F裂解，而O-聚糖可以與OglyZOR和SialEXO一起去除。。

從依那西普水解β1-3和β1-4半乳糖：Genovis的GalactEXO Immobilized 對 β1-3 和 β1-4 連接的半乳糖均具有酶活性，這些半乳糖存在于裝飾有 N- 和 O-連接糖基化的生物制藥中，例如 Fc-融合蛋白依那西普。將依那西普與GalactEXO固定化孵育60分鐘，并在FabRICATOR消化后使用LC-MS在亞基水平上研究酶活性。TNFR和Fc/2片段分別分析。與GalactEXO Immobilized孵育導致N-連接和O-連接聚糖上的半乳糖殘基水解，這在半乳糖基化物種中被視為信號丟失。對游離的N-聚糖分析證實了LC-MS數據。用SialEXO處理血清，上樣于GlycOCATCH，洗滌，洗脫O-糖基化蛋白。Swiss Prot 數據庫鑒定蛋白質列表。

GalNAcEXO固定化離心柱含有與瓊脂糖珠共價偶聯的GalNAcEXO酶，用于水解糖蛋白上的GalNAc殘基，而不會用酶污染制劑。Microspin 色譜柱可用于水解 5 或 10 x 0.5 mg 糖蛋白。1. 易于使用的離心柱；2. 提高酶與底物的比例，提高消化效率；3. 終樣品中不含酶。用于水解離心柱中糖蛋白上的Genovis的GalNAc殘基的固定化酶。GalNAcEXO 酶是一種n 外α-N-乙酰半乳糖氨酸酶，可快速有效地水解來自天然 O-糖蛋白的 z es GalNAc 殘基。 該酶來源于Akkermansia muciniphila，在大腸桿菌中表達，帶有His標簽，分子量為52 kDa。 該酶在 Tn 抗原和 α1-3 連接末端 GalNAcs 上均顯示活性。在這里，我們展示了如何使用GalNAcEXO來表征復雜的生物制藥。因此，其水解需要底物蛋白以與酶活性相容的方式變性。廣東用于自動化系統(tǒng)的96孔板形式PNGaseF去糖基化酶生物藥物開發(fā)

GalactEXO 是一種β-半乳糖苷酶混合物，可水解 N-和 O-糖基化蛋白中的 β1-3,4-連接末端半乳糖。湖北N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白質組學研究

用于水解離心柱中糖蛋白上的N-聚糖的固定化酶。 Genovis的PNGase F 固定化微離心柱含有與瓊脂糖珠共價偶聯的 PNGase F 酶，用于在樣品中酶峰減少的糖蛋白上水解 N-糖。 將糖蛋白樣品與PNGase F一起在離心柱中固定，然后通過離心步驟輕松收集去糖基化的蛋白質。由于空間位阻，PNGase F對某些糖蛋白的活性可能緩慢或受到抑制 - 在這些情況下可能需要更長的孵育時間或糖蛋白變性。 Microspin 色譜柱可用于水解 5 或 10 x 0.2 mg 糖蛋白。1. 易于使用的離心柱；2. 提高酶與底物的比例，提高消化效率；3.z終樣品中的酶峰減少。湖北N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白質組學研究