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來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2024-06-12

Co-IP(Co-Immunoprecipitation,共免疫沉淀)的實(shí)驗(yàn)方法通常包括以下步驟:
1. 細(xì)胞培養(yǎng)與裂解:細(xì)胞在適宜的培養(yǎng)條件下生長(zhǎng)到適當(dāng)?shù)拿芏取?/span>
蛋白質(zhì)分離:裂解后的細(xì)胞混合物通過(guò)離心去除未破碎的細(xì)胞碎片和未裂解的細(xì)胞。收集上清液
2. 抗體的添加:將特異性抗體(針對(duì)目標(biāo)蛋白質(zhì)的抗體)加入到裂解物中。
3. 免疫復(fù)合物的形成:抗體與目標(biāo)蛋白結(jié)合后,形成免疫復(fù)合物。
4. 親和介質(zhì)的使用:向混合物中添加蛋白A或蛋白G結(jié)合的珠子(如瓊脂糖或磁性珠子)。
5. 免疫復(fù)合物的捕獲:將混合物與珠子孵育一段時(shí)間后,使用磁鐵或離心的方法將珠子收集起來(lái),同時(shí)捕獲了與之結(jié)合的免疫復(fù)合物。
6. 洗滌:洗滌珠子以去除未特異性結(jié)合的蛋白質(zhì)和其他分子。
7. 洗脫:使用適當(dāng)?shù)木彌_液將免疫復(fù)合物從珠子上洗脫下來(lái),常用的緩沖液包括SDS樣品緩沖液,用于后續(xù)的電泳分析。
8. 蛋白質(zhì)分析:洗脫的蛋白質(zhì)可以通過(guò)SDS-PAGE凝膠電泳、Western blot、質(zhì)譜分析等方法進(jìn)行進(jìn)一步分析。
9. 實(shí)驗(yàn)對(duì)照:實(shí)驗(yàn)中應(yīng)包括陽(yáng)性對(duì)照和陰性對(duì)照,以確保實(shí)驗(yàn)結(jié)果的可靠性。
10. 數(shù)據(jù)分析:對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行分析,確認(rèn)目標(biāo)蛋白是否成功沉淀,并鑒定任何可能的相互作用蛋白。
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免疫沉淀技術(shù)RIP(RNA Immunoprecipitation,RNA免疫沉淀)是一種用于研究細(xì)胞內(nèi)RNA與蛋白質(zhì)相互作用的技術(shù)。RIP技術(shù)可以幫助我們了解轉(zhuǎn)錄后調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的動(dòng)態(tài)過(guò)程,并發(fā)現(xiàn)miRNA等非編碼RNA的調(diào)節(jié)靶點(diǎn)。
RIP技術(shù)的原理是利用針對(duì)特定RNA結(jié)合蛋白的抗體,將細(xì)胞內(nèi)的RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物沉淀下來(lái)。然后,可以通過(guò)分離純化,對(duì)這些復(fù)合物中的RNA進(jìn)行檢測(cè),如qPCR驗(yàn)證或測(cè)序分析。
表觀遺傳學(xué)和RNA生物學(xué)領(lǐng)域?qū)Σ煌琑NA作用和功能的關(guān)注增加。RNA-蛋白質(zhì)相互作用能夠調(diào)控mRNA和非編碼RNA的功能。對(duì)RNA潛能的這一新認(rèn)識(shí)帶動(dòng)了新方法的發(fā)展,使研究人員能夠定位 RNA-蛋白質(zhì)相互作用。
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免疫沉淀技術(shù)(Immunoprecipitation, IP)在生物醫(yī)學(xué)研究中有著廣泛的應(yīng)用,以下是一些主要的應(yīng)用領(lǐng)域:
1. 蛋白質(zhì)相互作用研究:IP技術(shù)可以用來(lái)研究蛋白質(zhì)之間的相互作用,揭示蛋白質(zhì)復(fù)合物的組成和蛋白質(zhì)之間的相互作用網(wǎng)絡(luò)。
2. 信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)研究:通過(guò)IP技術(shù),可以富集信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路中的關(guān)鍵蛋白質(zhì),研究信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的機(jī)制和調(diào)控[。
3. 蛋白質(zhì)修飾研究:IP技術(shù)可以用于富集經(jīng)過(guò)特定修飾的蛋白質(zhì),例如磷酸化、乙?;龋M(jìn)而研究蛋白質(zhì)修飾的功能和調(diào)控。
4. 藥物靶點(diǎn)篩選:IP技術(shù)可以用于富集藥物靶點(diǎn)蛋白質(zhì),幫助篩選潛在的藥物靶點(diǎn)。
5. 疾病機(jī)制研究:通過(guò)分析疾病相關(guān)蛋白質(zhì)的相互作用,IP技術(shù)有助于揭示疾病的分子機(jī)制,為理解疾病的發(fā)展過(guò)程和尋找靶點(diǎn)提供重要信息。
6. 藥物相互作用分析:IP技術(shù)可以用于分析藥物與蛋白質(zhì)的相互作用,為藥物作用機(jī)制研究提供重要信息。
7. 生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn):IP技術(shù)可以用于鑒定與疾病狀態(tài)相關(guān)的蛋白質(zhì)相互作用,篩選出潛在的生物標(biāo)志物,用于疾病的診斷和預(yù)后評(píng)估。

RIP 技術(shù)的原理(RNA Binding Protein Immunoprecipitation Assay,RNA 結(jié)合蛋白免疫沉淀)主要是運(yùn)用針對(duì)目標(biāo)蛋白的抗體把相應(yīng)的RNA-蛋白復(fù)合物沉淀下來(lái),經(jīng)過(guò)分離純化就可以對(duì)結(jié)合在復(fù)合物上的RNA 進(jìn)行q-PCR驗(yàn)證或者測(cè)序分析。

RIP 是研究細(xì)胞內(nèi)RNA 與蛋白結(jié)合情況的技術(shù),是了解轉(zhuǎn)錄后調(diào)控網(wǎng)絡(luò)動(dòng)態(tài)過(guò)程的有力工具。RIP可以看成是普遍使用的染色質(zhì)免疫沉淀ChIP技術(shù)的類似應(yīng)用,但由于研究對(duì)象是RNA-蛋白復(fù)合物而不是DNA-蛋白復(fù)合物,RIP實(shí)驗(yàn)的優(yōu)化條件與ChIP實(shí)驗(yàn)不太相同,如:RIP反應(yīng)體系中的試劑和抗體不能含有RNA酶,抗體需經(jīng)RIP實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證等等。
免疫沉淀技術(shù)Co-IP的優(yōu)缺點(diǎn)是什么?

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免疫沉淀ChIP實(shí)驗(yàn)中磁珠還是瓊脂糖珠的選擇取決于客戶實(shí)驗(yàn)情況。
瓊脂糖珠海綿狀的結(jié)構(gòu)  (直徑 50-150 μm)  可以結(jié)合抗體  (繼而結(jié)合靶蛋白) ,它能夠直接高效、快速結(jié)合抗體,而不需借助特殊的專業(yè)設(shè)備。瓊脂糖珠呈多孔結(jié)構(gòu),這使得它們擁有更大的表面積可與蛋白質(zhì)相互接觸,具有更高的結(jié)合載量。
與瓊脂糖珠不同,磁珠是固體,抗體的結(jié)合限于磁珠的表面。磁珠 (直徑 1-4 μm) 明顯小于瓊脂糖珠 ,盡管磁珠沒(méi)有多孔中心增加結(jié)合能力,但每體積的磁珠數(shù)量比瓊脂糖珠多,使磁珠擁有足夠的抗體結(jié)合表面積滿足高容量的抗體結(jié)合。
簡(jiǎn)而言之,瓊脂糖珠的結(jié)合能力較強(qiáng),而磁珠在得率,可重復(fù)性以及自動(dòng)化方面有明顯的優(yōu)勢(shì)。
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免疫沉淀技術(shù)的實(shí)驗(yàn)方法。溫州Protein AG免疫沉淀磁珠現(xiàn)貨

免疫共沉淀分析(Co-IP)與IP十分類似,基本的技術(shù)都是采用目標(biāo)抗原特異性的固相化抗體;但I(xiàn)P的目標(biāo)是純化單一抗原,而Co-IP旨在分離抗原及與抗原結(jié)合的蛋白質(zhì)或配體。

在Co-IP實(shí)驗(yàn)中,已知抗原稱為誘餌蛋白,與之結(jié)合的蛋白則稱為靶蛋白。靶蛋白可能是一些復(fù)雜的伴侶蛋白、信號(hào)分子、結(jié)構(gòu)蛋白、輔助因子等,蛋白間相互作用強(qiáng)度范圍可能介于高度瞬時(shí)和十分穩(wěn)定之間。
基本的Co-IP實(shí)驗(yàn)方案與IP相同,實(shí)際上任何IP系統(tǒng)均可用于Co-IP。但是,還有許多其他因素需要考慮,例如,結(jié)合和洗滌條件的優(yōu)化,優(yōu)化時(shí),需要考慮到誘餌蛋白-靶蛋白的相互作用強(qiáng)度以及抗體-誘餌蛋白的親和力。
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標(biāo)簽: 支原體 免疫沉淀