珠海實時RT-PCR檢測技術(shù)服務

來源: 發(fā)布時間:2021-12-12

聚合酶鏈式反應準備:10×擴增緩沖液、4種dNTP混合物(終濃度)、引物(終濃度)、模板DNA、Taq DNA聚合酶、Mg2+(終濃度)、補加雙蒸水等。其中dNTP、引物、模板DNA、Taq DNA聚合酶以及Mg2+的加量(或濃度)可根據(jù)實驗調(diào)整,以上表格只提供大致參考值。PCR反應五要素:參加PCR反應的物質(zhì)主要有五種即:引物(PCR引物為DN段,細胞內(nèi)DNA復制的引物為一段RNA鏈)、酶、dNTP、模板和緩沖液(其中需要Mg2+)。引物有多種設計方法,由PCR在實驗中的目的決定,但基本原則相同。聚合酶鏈式反應中的DMSO、甘油等,主要用來保持酶的活性和幫助DNA解除纏繞結(jié)構(gòu)。珠海實時RT-PCR檢測技術(shù)服務

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聚合酶鏈反應的常見問題分析與解決方法:MgCl2濃度過高??蛇m當降低其用量。模板量過多。質(zhì)粒DNA的用量應<50 ng,而基因組DNA則應<200 ng。引物濃度不夠優(yōu)化。對引物進行梯度稀釋重復PCR反應。循環(huán)次數(shù)過多;增加模板量減少循環(huán)次數(shù)至30,縮短退火時間及延伸時間,或改用二種溫度的PCR循環(huán)。退火溫度過低。電泳體系有問題:凝膠中緩沖液和電泳緩沖液濃度相差太大;凝膠沒有凝固好;瓊脂糖質(zhì)量差。若為PCR試劑盒則可能:由于運輸儲存不當引起試劑盒失效;試劑盒本身質(zhì)量有問題,如引物選擇、循環(huán)參數(shù)等選擇不當。降解的陳舊模板擴增也易產(chǎn)生涂布。蘇州細胞Real-time PCR應用序列間特異性聚合酶鏈反應是一種用于DNA指紋識別的聚合酶鏈反應方法。

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聚合酶鏈反應:在檢測病原體方面,病原體培養(yǎng)是臨床診斷的金標準 .但是對于一些苛養(yǎng)菌 生長緩慢的細菌或難以培養(yǎng)的病原體等培養(yǎng)的陽性檢出率不高.檢測時間過長 無法滿足臨床早期快速診斷以指導醫(yī)治的需要[3]。當前 PCR 技術(shù)是在傳統(tǒng) PCR 技術(shù)應用的基礎上進行的改進,包括實時定量 PCR 技術(shù) 、 實時熒光定量PCR、 PCR-酶聯(lián)免疫吸附試驗 、 巢式PCR等。 在PCR技術(shù)的輔助作用下,實驗室檢測也逐漸從生化免疫診斷過渡到基因診斷,生化免疫檢測主要從表型表現(xiàn)評估病癥,而基因診斷則深入本質(zhì)探究其病因,以PCR 技術(shù)為主的核酸技術(shù)在臨床實驗室檢測與疾病診斷中表現(xiàn)出了明顯的應用價值,在未來的臨床醫(yī)學檢驗中必將會得到更加較廣的應用。

聚合酶鏈式反應的循環(huán)參數(shù):預變性,模板DNA完全變性與PCR酶的完全對PCR能否成功至關(guān)重要,建議加熱時間參考試劑說明書,一般未修飾的Taq酶時間為兩分鐘。變性步驟,循環(huán)中一般95℃,30秒足以使各種靶DNA序列完全變性,可能的情況下可縮短該步驟時間。變性時間過長損害酶活性,過短靶序列變性不徹底,易造成擴增失敗。引物退火,退火溫度需要從多方面去決定,一般根據(jù)引物的Tm值為參考,根據(jù)擴增的長度適當下調(diào)作為退火溫度。然后在此次實驗基礎上做出預估。退火溫度對PCR的特異性有較大影響。引物延伸,引物延伸一般在72℃進行(Taq酶很適溫度)。但在擴增長度較短且退火溫度較高時,本步驟可省略延伸時間隨擴增片段長短而定,一般推薦在1000bp以上,含Pfu及其衍生物的衍生設定為1min/kbp。循環(huán)數(shù),大多數(shù)PCR含25-35循環(huán),過多易產(chǎn)生非特異擴增。延伸,在一個循環(huán)后,反應在72℃維持10-30分鐘.使引物延伸完全,并使單鏈產(chǎn)物退火成雙鏈。聚合酶鏈式反應的模板的取材主要依據(jù)PCR的擴增對象,可以是病原體標本如病毒、細菌、菌類等。

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聚合酶鏈式反應準備:PCR所用的酶主要有兩種來源:Taq和Pfu,分別來自兩種不同的噬熱菌。其中Taq擴增效率高但易發(fā)生錯配。Pfu擴增效率弱但有糾錯功能。所以實際使用時根據(jù)需要必須做不同的選擇。模板即擴增用的DNA,可以是任何來源,但有兩個原則,純度必須較高,第二濃度不能太高以免抑制。緩沖液的成分很為復雜,除水外一般包括四個有效成分:緩沖體系,一般使用HEPES或MOPS緩沖體系;一價陽離子,一般采用鉀離子,但在特殊情況下也可使用銨根離子;二價陽離子,即鎂離子,根據(jù)反應體系確定,除特殊情況外不需調(diào)整;輔助成分,常見的有DMSO、甘油等,主要用來保持酶的活性和幫助DNA解除纏繞結(jié)構(gòu)。聚合酶鏈反應可以用于分析病癥、微生物或其他疾病狀態(tài)中基因表達水平的變化。常州微量定量PCR技術(shù)服務

在嵌套聚合酶鏈反應中,除了預期的靶之外,該產(chǎn)物可能仍然由非特異性擴增的DN段組成。珠海實時RT-PCR檢測技術(shù)服務

聚合酶鏈式反應的常見問題:PCR產(chǎn)物的電泳檢測時間一般為48h以內(nèi),有些很好于當日電泳檢測,大于48h后帶型不規(guī)則甚至消失。假陰性:不出現(xiàn)擴增條帶。PCR反應的關(guān)鍵環(huán)節(jié)有模板核酸的制備,引物的質(zhì)量與特異性,酶的質(zhì)量及溴乙錠的使用, PCR循環(huán)條件。尋找原因亦應針對上述環(huán)節(jié)進行分析研究。模板:模板中含有雜蛋白質(zhì),模板中含有Taq酶抑制劑,模板中蛋白質(zhì)沒有消化除凈,特別是染色體中的組蛋白,在提取制備模板時丟失過多,或吸入酚。模板核酸變性不徹底。在酶和引物質(zhì)量好時,不出現(xiàn)擴增帶,極有可能是標本的消化處理,模板核酸提取過程出了毛病,因而要配制有效而穩(wěn)定的消化處理液,其程序亦應 固定不宜隨意更改。珠海實時RT-PCR檢測技術(shù)服務