廣州實(shí)時(shí)數(shù)字PCR應(yīng)用

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2023-03-06

Real-time PCR:實(shí)時(shí)熒光定量PCR是目前確定樣品中DNA(或cDNA)拷貝數(shù)較敏感、較準(zhǔn)確的方法。如果用于RNA檢測(cè),這被稱(chēng)為逆轉(zhuǎn)錄實(shí)時(shí)PCR即(Real-timeRT-PCR)是實(shí)時(shí)PCR法,它是指對(duì)DNA或經(jīng)過(guò)反轉(zhuǎn)入(RT-PCR)的RNA通過(guò)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)并實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)DNA的放大過(guò)程,在擴(kuò)增的指數(shù)增長(zhǎng)期就測(cè)量擴(kuò)增產(chǎn)物,因?yàn)閿U(kuò)增指數(shù)增長(zhǎng)期測(cè)量值與特異DNA(RNA)起始量存在相關(guān)性,從而實(shí)現(xiàn)定量檢測(cè)。Real-time PCR的基本目標(biāo)是精確測(cè)量和鑒別非常微量的特異性核酸,從而可通過(guò)監(jiān)測(cè)CT值而實(shí)現(xiàn)對(duì)原始目標(biāo)基因的含量定量。實(shí)時(shí)熒光定量PCR法較大的優(yōu)點(diǎn)是克服了終點(diǎn)PCR法進(jìn)入平臺(tái)期或叫飽和期后定量的較大誤差,實(shí)現(xiàn)DNA/RNA的精確定量。該技術(shù)不單單實(shí)現(xiàn)了對(duì)DNA/RNA模板的定量,而且具有靈敏度和特異性高、能實(shí)現(xiàn)多重反應(yīng)、自動(dòng)化程度高、無(wú)污染、實(shí)時(shí)和準(zhǔn)確等特點(diǎn),該技術(shù)在醫(yī)學(xué)臨床檢驗(yàn)及臨床醫(yī)學(xué)研究方面有著重要的意義。實(shí)時(shí)熒光定量PCR以熒光化學(xué)物質(zhì)測(cè)每次聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)循環(huán)后產(chǎn)物總量的方法。廣州實(shí)時(shí)數(shù)字PCR應(yīng)用

廣州實(shí)時(shí)數(shù)字PCR應(yīng)用,Real-timePCR技術(shù)服務(wù)

Real-time PCR原理:所謂實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù),是指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán),利用熒光信號(hào)積累實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)整個(gè)PCR進(jìn)程,通過(guò)標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)對(duì)未知模板進(jìn)行定量分析的方法。DNA結(jié)合染料法,應(yīng)用一種帶有熒光的、非特異的DNA結(jié)合染料檢測(cè)PCR過(guò)程中積累的擴(kuò)增產(chǎn)物。檢測(cè)所有雙鏈DNA擴(kuò)增產(chǎn)物,包括非特異反應(yīng)產(chǎn)物,如引物二聚體??蓪?duì)任何雙鏈DNA進(jìn)行定量;不需要探針,因此減少了實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及運(yùn)轉(zhuǎn)成本;適合于大量基因的分析;簡(jiǎn)單易用。實(shí)時(shí)熒光定量PCR:實(shí)時(shí)熒光定量PCR(QuantitativeReal-time PCR)是一種在DNA擴(kuò)增反應(yīng)中,以熒光化學(xué)物質(zhì)測(cè)每次聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)循環(huán)后產(chǎn)物總量的方法。通過(guò)內(nèi)參或者外參法對(duì)待測(cè)樣品中的特定DNA序列進(jìn)行定量分析的方法。Real-time PCR是在PCR擴(kuò)增過(guò)程中,通過(guò)熒光信號(hào),對(duì)PCR進(jìn)程進(jìn)行實(shí)時(shí)檢測(cè)。由于在PCR擴(kuò)增的指數(shù)時(shí)期,模板的Ct值和該模板的起始拷貝數(shù)存在線(xiàn)性關(guān)系,所以成為定量的依據(jù)。徐州特殊樣本數(shù)字PCR網(wǎng)站電子聚合酶鏈反應(yīng)是指計(jì)算工具使用給定的一組引物來(lái)擴(kuò)增來(lái)自測(cè)序的基因組或轉(zhuǎn)錄組的DNA 序列。

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聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)又稱(chēng)多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng),是一項(xiàng)利用DNA雙鏈復(fù)制的原理,在生物體外復(fù)制特定DN段的核酸合成技術(shù)。透過(guò)這項(xiàng)技術(shù),可在短時(shí)間內(nèi)大量擴(kuò)增目的基因,而不必依賴(lài)大腸桿菌或酵母菌等生物體。聚合酶鏈反應(yīng)是是一種簡(jiǎn)單,廉價(jià)和可靠的方法復(fù)制DN段,這個(gè)概念適用于現(xiàn)物學(xué)和相關(guān)科學(xué)的許多領(lǐng)域。PCR可能是分子生物學(xué)中使用很較廣的技術(shù)。這種技術(shù)被用于生物醫(yī)學(xué)研究,犯罪取證和分子考古學(xué)。通常,PCR由一系列20-40次重復(fù)的溫度變化組成,稱(chēng)為熱循環(huán),每個(gè)循環(huán)通常由兩個(gè)或三個(gè)離散的溫度步驟組成。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)準(zhǔn)備:引物內(nèi)部不應(yīng)出現(xiàn)互補(bǔ)序列。

Real-time PCR實(shí)驗(yàn)常用的RNA酶抑制劑:1.焦磷酸二乙酯(DEPC):是一種強(qiáng)烈但不徹底的RNA酶抑制劑。它通過(guò)和RNA酶的活性基團(tuán)組氨酸的咪唑環(huán)結(jié)合使蛋白質(zhì)變性,從而抑制酶的活性。2.異硫氰酸胍:目前被認(rèn)為是較有效的RNA酶抑制劑,它在裂解組織的同時(shí)也使RNA酶失活。它既可破壞細(xì)胞結(jié)構(gòu)使核酸從蛋白中解離出來(lái),又對(duì)RNA酶有強(qiáng)烈的變性作用。3.氧釩核糖核苷復(fù)合物:由氧化釩離子和核苷形成的復(fù)合物,它和RNA酶結(jié)合形成過(guò)渡態(tài)類(lèi)物質(zhì),幾乎能完全抑制RNA酶的活性。4.RNA酶的蛋白抑制劑(RNasin):從大鼠肝或人胎盤(pán)中提取得來(lái)的酸性糖蛋白。RNasin是RNA酶的一種非競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑,可以和多種RNA酶結(jié)合,使其失活。5.其它:SDS、尿素、硅藻土等對(duì)RNA酶也有一定抑制作用。Real-time PCR在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中為了防止非特異性擴(kuò)增,必須設(shè)陰性對(duì)照。

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Real-timePCR技術(shù)服務(wù)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的試驗(yàn)污染:實(shí)驗(yàn)室中克隆質(zhì)粒的污染:在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室及某些用克隆質(zhì)粒做陽(yáng)性對(duì)照的檢驗(yàn)室,這個(gè)問(wèn)題也比較常見(jiàn)。因?yàn)榭寺≠|(zhì)粒在單位容積內(nèi)含量相當(dāng)高,另外在純化過(guò)程中需用較多的用具及試劑,而且在活細(xì)胞內(nèi)的質(zhì)粒,由于活細(xì)胞的生長(zhǎng)繁殖的簡(jiǎn)便性及具有很強(qiáng)的生命力。其污染可能性也很大。污染的監(jiān)測(cè):一個(gè)好的實(shí)驗(yàn)室,要時(shí)刻注意污染的監(jiān)測(cè),考慮有無(wú)污染是什么原因造成的污染,以便采取措施,防止和消除污染。重復(fù)性試驗(yàn)。選擇不同區(qū)域的引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增。所謂Real-time PCR技術(shù),是指在PCR反應(yīng)體系中加入螢光基團(tuán)。廣州實(shí)時(shí)數(shù)字PCR應(yīng)用

在PCR產(chǎn)物中,由于內(nèi)標(biāo)與靶模板的長(zhǎng)度不同。廣州實(shí)時(shí)數(shù)字PCR應(yīng)用

Real-time PCR探針?lè)ㄟm用于:1、具有高適應(yīng)性和可靠性,實(shí)驗(yàn)結(jié)果穩(wěn)定重複性好,特異性更高。2、適用于擴(kuò)增序列專(zhuān)一的體系的檢測(cè)。3、樣品中靶基因含量過(guò)低的定量PCR檢測(cè)。4、靶基因的特異序列較短,無(wú)論怎樣較佳化引物設(shè)計(jì)條件都不能解決。5、存在與靶基因同源的序列,在PCR中容易出現(xiàn)非特異性擴(kuò)增,對(duì)特異性要求較高的定量。6、普遍用于人類(lèi)傳染病的診斷和病原定量,在動(dòng)物病原體基因的檢測(cè),畜禽產(chǎn)品的檢驗(yàn)檢疫,生物製品的鑒定。Real-time PCR探針?lè)?PCR擴(kuò)增時(shí)在加入一對(duì)引物的同時(shí)加入一個(gè)特異性的螢光探針,該探針為一寡核苷酸,兩端分別標(biāo)記一個(gè)報(bào)告螢光基團(tuán)和一個(gè)淬滅螢光基團(tuán)。探針完整時(shí),報(bào)告基團(tuán)發(fā)射的螢光信號(hào)被淬滅基團(tuán)吸收;PCR擴(kuò)增時(shí),Taq酶的5’-3’外切酶活性將探針酶切降解,使報(bào)告螢光基團(tuán)和淬滅螢光基團(tuán)分離,從而螢光監(jiān)測(cè)系統(tǒng)可接收到螢光信號(hào),即每擴(kuò)增一條DNA鏈,就有一個(gè)螢光分子形成,實(shí)現(xiàn)了螢光信號(hào)的累積與PCR產(chǎn)物形成完全同步。廣州實(shí)時(shí)數(shù)字PCR應(yīng)用

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