上海細(xì)胞定量PCR原理及步驟

來源: 發(fā)布時間:2023-02-17

Real-time PCR從用途上分可以分為定性分析和定量分析:定性分析指的是用于分析待檢測的樣本中是否存在我們想要檢測的成分,即待檢測成分有無的分析。通常,定性分析可以應(yīng)用于病毒以及病原菌的檢測,物種鑒定以及基因分型等。病毒及病原菌檢測,如SARS、H1N1病毒,都可以通過Real-time PCR的方法進(jìn)行高靈敏度的檢測,定性分析樣本是否已被病毒傳播。物種鑒定如我們國家的一些檢驗檢疫機(jī)構(gòu),想要檢測進(jìn)口的牛肉制品中是否含有雞源、豬源或鴨源等成分,或者用于檢測羊奶中是否會摻有牛奶等等,可以通過Real-time PCR的方法進(jìn)行檢測?;蚍中停缙【菩?,肥胖型基因的檢測,就是Real-time PCR在基因分型方面的應(yīng)用。PCR產(chǎn)物的電泳檢測時間一般為48h以內(nèi),有些很好于當(dāng)日電泳檢測,大于48h后帶型不規(guī)則甚至消失。上海細(xì)胞定量PCR原理及步驟

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Real-time PCR從用途上分可以分為定性分析和定量分析:定量分析可以分為定量和相對定量兩種。定量指的是我們想知道某個基因在初始樣品中具體的拷貝數(shù)或濃度是多少?定量實驗必須使用已知拷貝數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)品,必須做標(biāo)準(zhǔn)曲線。而相對定量是指我們想知道某一個基因在不同樣品中表達(dá)量的差異,其目的是測定目的基因在兩個或多個樣本中的含量的相對比例,而不需要知道它們在每個樣本中的拷貝數(shù)。舉例來說,如研究項目中包括使用高鹽脅迫處理的樣本和未高鹽脅迫處理的樣本,記為已處理樣本和未處理樣本,通??梢詫⑽刺幚順颖局付榛鶞?zhǔn),規(guī)定其目的基因濃度為100%,用已處理樣本的定量結(jié)果除以未處理樣本的定量結(jié)果,就可以計算每個已處理樣本的基因含量相對于未處理樣本的百分比。相對定量可以應(yīng)用于差異顯示結(jié)果驗證、基因芯片結(jié)果驗證、siRNA效果確認(rèn)、mRNA表達(dá)量分析等等。蘇州組織數(shù)字PCR研究方案聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的引物與模板的結(jié)合及引物鏈的延伸是遵循堿基配對原則的。

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Real-time PCR:實時熒光定量PCR是目前確定樣品中DNA(或cDNA)拷貝數(shù)較敏感、較準(zhǔn)確的方法。如果用于RNA檢測,這被稱為逆轉(zhuǎn)錄實時PCR即(Real-timeRT-PCR)是實時PCR法,它是指對DNA或經(jīng)過反轉(zhuǎn)入(RT-PCR)的RNA通過聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)并實時監(jiān)測DNA的放大過程,在擴(kuò)增的指數(shù)增長期就測量擴(kuò)增產(chǎn)物,因為擴(kuò)增指數(shù)增長期測量值與特異DNA(RNA)起始量存在相關(guān)性,從而實現(xiàn)定量檢測。Real-time PCR的基本目標(biāo)是精確測量和鑒別非常微量的特異性核酸,從而可通過監(jiān)測CT值而實現(xiàn)對原始目標(biāo)基因的含量定量。實時熒光定量PCR法較大的優(yōu)點是克服了終點PCR法進(jìn)入平臺期或叫飽和期后定量的較大誤差,實現(xiàn)DNA/RNA的精確定量。該技術(shù)不單單實現(xiàn)了對DNA/RNA模板的定量,而且具有靈敏度和特異性高、能實現(xiàn)多重反應(yīng)、自動化程度高、無污染、實時和準(zhǔn)確等特點,該技術(shù)在醫(yī)學(xué)臨床檢驗及臨床醫(yī)學(xué)研究方面有著重要的意義。

Real-time PCR原理:基于探針的化學(xué)法,Real-time PCR應(yīng)用一個或多個熒光標(biāo)記的寡核苷酸探針檢測PCR擴(kuò)增產(chǎn)物;依賴熒光能量共振傳遞(FRET)檢測特異性擴(kuò)增產(chǎn)物,單單檢測特異性擴(kuò)增產(chǎn)物,DNA及RNA定量;基因表達(dá)驗證;等位基因鑒別;SNP分型;病原體和病毒檢測;多重PCR,探針和目標(biāo)片段的特異性結(jié)合產(chǎn)生熒光信號,因此減少了背景熒光和假陽性;探針可標(biāo)記不同波長的熒光基團(tuán),用于多重PCR反應(yīng)。對于不同的靶序列需要合成不同的探針,原料成本較高。聚合酶鏈反應(yīng)五要素:參加PCR反應(yīng)的物質(zhì)主要有五種即:引物、酶、dNTP、模板和緩沖液。

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Real-time PCR反應(yīng):多重連接依賴探針擴(kuò)增(MLPA):允許用單個引物對擴(kuò)增多個靶標(biāo),從而避免多重PCR的分辨率限制。多重聚合酶鏈反應(yīng):由單個PCR混合物中的多個引物組組成,以產(chǎn)生對不同DNA序列特異的不同大小的擴(kuò)增子。通過同時靶向多個基因,可以從單次測試中獲得額外的信息,否則將需要幾次試劑和更多時間來執(zhí)行。每個引物組的退火溫度必須優(yōu)化,以在單個反應(yīng)中正確工作,并符合擴(kuò)增子尺寸。也就是說,當(dāng)通過凝膠電泳可視化時,它們的堿基對長度應(yīng)該足夠不同以形成不同的條帶。PCR由變性-退火-延伸三個基本反應(yīng)步驟構(gòu)成。上海細(xì)胞定量PCR原理及步驟

實時熒光定量PCR技術(shù)有效地解決了傳統(tǒng)定量只能終點檢測的局限。上海細(xì)胞定量PCR原理及步驟

Real-time PCR螢光染料摻入法:在PCR反應(yīng)體系中,加入過量SYBR螢光染料,SYBR螢光染料特異性地?fù)饺隓NA雙鏈后,發(fā)射螢光信號,而不摻入鏈中的SYBR染料分子不會發(fā)射任何螢光信號,從而保證螢光信號的增加與PCR產(chǎn)物的增加完全同步。此方法適用于:1、靈敏度高:使用SYBR可使螢光效果增強到1000倍以上。2、通用性好,不需要設(shè)計探針,方法簡便,省時,價格低廉。3、通用型方法,在國內(nèi)外科研中普遍使用。4、高通量大規(guī)模的定量PCR檢測。5、專一性要求不高的定量PCR檢測。上海細(xì)胞定量PCR原理及步驟

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