無錫血液RT-PCR檢測技術(shù)應用

來源: 發(fā)布時間:2022-06-16

聚合酶鏈式反應是80年代中期發(fā)展起來的體外核酸擴增技術(shù)。工具/原料:擴增緩沖液,四種dNTP,引物,模板DNA,Taq DNA聚合酶, Mg離子,蒸餾水。模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至93℃左右一定時間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結(jié)合,為下輪反應作準備;模板DNA與引物的退火(復性):模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補序列配對結(jié)合;引物的延伸:DNA模板--引物結(jié)合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP為反應原料,靶序列為模板,按堿基配對與半保留復制原理,合成一條新的與模板DNA 鏈互補的半保留復制鏈。重復循環(huán)變性--退火--延伸三過程,就可獲得更多的“半保留復制鏈”,而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。熱啟動/冷完成聚合酶鏈反應是通過新的雜合聚合酶實現(xiàn)的,這些酶在環(huán)境溫度下不活躍。無錫血液RT-PCR檢測技術(shù)應用

無錫血液RT-PCR檢測技術(shù)應用,Real-timePCR技術(shù)服務

聚合酶鏈式反應的常見問題:靶序列變異:如靶序列發(fā)生突變或缺失,影響引物與模板特異性結(jié)合,或因靶序列某 段缺失使引物與模板失去互補序列,其PCR擴增是不會成功的。假陽性:出現(xiàn)的PCR擴增條帶與目的靶序列條帶一致,有時其條帶更整齊,亮度更高。引物設計不合適:選擇的擴增序列與非目的擴增序列有同源性,因而在進行PCR擴增時,擴增出的PCR產(chǎn)物為非目的性的序列。靶序列太短或引物太短,容易出現(xiàn)假陽性。需重新設計引物。出現(xiàn)片狀拖帶或涂抹帶:PCR擴增有時出現(xiàn)涂抹帶或片狀帶或地毯樣帶。其原因往往由于酶量過多或酶的質(zhì)量差,dNTP濃度過高,Mg2+濃度過高,退火溫度過低,循環(huán)次數(shù)過多引起。其對策有:減少酶量,或調(diào)換另一來源的酶。②減少dNTP的濃度。適當降低Mg2+濃 度。增加模板量,減少循環(huán)次數(shù)。南京細胞Real-time PCR服務聚合酶鏈反應五要素:參加PCR反應的物質(zhì)主要有五種即:引物、酶、dNTP、模板和緩沖液。

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聚合酶鏈式反應:DNA的半保留復制是生物進化和傳代的重要途徑。雙鏈DNA在多種酶的作用下可以變性解旋成單鏈,在DNA聚合酶的參與下,根據(jù)堿基互補配對原則復制成同樣的兩分子拷貝。在實驗中發(fā)現(xiàn),DNA在高溫時也可以發(fā)生變性解鏈,當溫度降低后又可以復性成為雙鏈。因此,通過溫度變化控制DNA的變性和復性,加入設計引物,DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的體外復制。但是,DNA聚合酶在高溫時會失活,因此,每次循環(huán)都得加入新的DNA聚合酶,不但操作煩瑣,而且價格昂貴,制約了PCR技術(shù)的應用和發(fā)展。耐熱DNA聚合酶-Taq酶的發(fā)現(xiàn)對于PCR的應用有里程碑的意義,該酶可以耐受90℃以上的高溫而不失活,不需要每個循環(huán)加酶,使PCR技術(shù)變得非常簡捷、同時也降低了成本,PCR技術(shù)得以大量應用,并逐步應用于臨床。

聚合酶鏈式反應(PCR)是一種用于放大擴增特定的DN段的分子生物學技術(shù),它可看作是生物體外的特殊DNA復制,PCR的很大特點是能將微量的DNA大幅增加?;蚬こ蹋荷锊牧稀猰RNA,將mRNA反轉(zhuǎn)錄后成為cDNA(互補DNA),通過PCR擴增。這里不是信使RNA,而是病毒RNA作為生物材料進行PCR聚合酶鏈式反應。作用——體外將病毒RNA分子結(jié)構(gòu)進行修飾,其次將目的基因?qū)胧荏w細胞中,進行病。RNA的表現(xiàn)形式:RNA病毒一般由蛋白質(zhì)和RNA組成,現(xiàn)在看下RNA——一條核糖核酸長鏈,核糖核酸長鏈由無數(shù)個核糖核苷酸分子構(gòu)成,其中,一個核糖核苷酸分子由一分子磷酸、一分子核糖(一種五碳糖)、一分子含氮堿基構(gòu)成。脫氧核糖核苷酸分子比核糖核苷酸分子少了一個O分子。為了很大限度地減少污染的可能性,調(diào)查人員應該為試劑制備、聚合酶鏈反應和產(chǎn)品分析預留單獨的房間。

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聚合酶鏈反應的常見問題分析與解決方法:PCR產(chǎn)物量過少:退火溫度不合適。以2度為梯度設計梯度PCR反應優(yōu)化退火溫度。DNA模板量太少。增加DNA模板量。PCR循環(huán)數(shù)不足。增加反應循環(huán)數(shù)。引物量不足。增加體系中引物含量。延伸時間太短。以1 kb/min的原則設置延伸時間。變性時間過長。變性時間過長會導致DNA聚合酶失活。DNA模板中存在抑制劑。確保DNA模板干凈。擴增產(chǎn)物在凝膠中涂布或成片狀條帶彌散:酶量過高。減少酶量;酶的質(zhì)量差,調(diào)換另一來源的酶。dNTP濃度過高。減少dNTP的濃度。PCR反應的關鍵環(huán)節(jié)有模板核酸的制備,引物的質(zhì)量與特異性,酶的質(zhì)量及溴乙錠的使用。南京細胞Real-time PCR服務

許多疾病的未知病因的測序正在通過聚合酶鏈反應得到解決。無錫血液RT-PCR檢測技術(shù)應用

聚合酶鏈式反應的常見問題:Mg2+濃度:Mg2+離子濃度對PCR擴增效率影響很大,濃度過高可降低PCR擴增的特 異性,濃度過低則影響PCR擴增產(chǎn)量甚至使PCR擴增失敗而不出擴增條帶。反應體積的改變:通常進行PCR擴增采用的體積為20ul、30ul、50ul?;?00ul,應用多 大體積進行PCR擴增,是根據(jù)科研和臨床檢測不同目的而設定,在做小體積如20ul 后,再做大體積時,一定要模索條件,否則容易失敗。物理原因:變性對PCR擴增來說相當重要,如變性溫度低,變性時間短,極有可能出現(xiàn)假陰性;退火溫度過低,可致非特異性擴增而降低特異性擴增效率退火溫度過高影響引物與模板的結(jié)合而降低PCR擴增效率。有時還有必要用標準的溫度計,檢測一下擴增儀或水溶鍋內(nèi)的變性、退火和延伸溫度,這也是PCR失敗的原因之一。無錫血液RT-PCR檢測技術(shù)應用