南通分子生物學熒光定量PCR原理

來源: 發(fā)布時間:2022-03-20

聚合酶鏈式反應的常見問題:出現(xiàn)非特異性擴增帶:PCR擴增后出現(xiàn)的條帶與預計的大小不一致,或大或小,或者同時出現(xiàn)特異性擴增帶 與非特異性擴增帶。非特異性條帶的出現(xiàn),其原因:一是引物與靶序列不完全互補、或引物聚合形成二聚體。二是Mg2+離子濃度過高、退火溫度過低,及PCR循環(huán)次數(shù)過多有關。其次是酶的質和量,往往一些來源的酶易出現(xiàn)非特異條帶而另一來源的酶則不出現(xiàn),酶量過多有時也會出現(xiàn)非特異性擴增。其對策有:必要時重新設計引 物。減低酶量或調換另一來源的酶。降低引物量,適當增加模板量,減少循環(huán)次數(shù)。適當提高退火溫度或采用二溫度點法(93℃變性,65℃左右退火與延伸)。聚合酶鏈式反應的特異性依賴于與靶序列兩端互補的寡核苷酸引物。南通分子生物學熒光定量PCR原理

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聚合酶鏈式反應的試驗污染:陽性對照:在建立PCR反應實驗室及一般的檢驗單位都應設有PCR陽性對照,它是PCR反應是否成功、產(chǎn)物條帶位置及大小是否合乎理論要求的一個重要的參考標志。陽性對照要選擇擴增度中等、重復性好,經(jīng)各種鑒定是該產(chǎn)物的標本,如以重組質粒為陽性對照,其含量宜低不宜高(100個拷貝以下)。但陽性對照尤其是重組質粒及高濃度陽性標本,其對檢測或擴增樣品污染的可能性很大。因而當某一PCR試劑經(jīng)自己使用穩(wěn)定,檢驗人員心中有數(shù)時,在以后的實驗中可免設陽性對照。陰性對照:每次PCR實驗務必做陰性對照。它包括:標本對照:被檢的標本是血清就用鑒定后的正常血清作對照;被檢的標本是組織細胞就用相應的組織細胞作對照。試劑對照:在PCR試劑中不加模板DNA或RNA,進行PCR擴增,以監(jiān)測試劑是否污染。南通分子生物學熒光定量PCR原理聚合酶鏈式反應(PCR)是一種用于放大擴增特定的DN段的分子生物學技術。

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聚合酶鏈反應的常見問題分析與解決方法:無擴增條帶:酶失活或在反應體系中未加入酶。Taq DNA聚合酶因保存或運輸不當而失活,往往通過更換新酶或用另一來源的酶以獲得滿意的結果。模板含有雜質。特別是對甲醛固定及石蠟包埋的組織常含甲酸,造成DNA脫嘌呤而影響PCR的結果。變性溫度是否準確:PCR儀指示溫度與實際溫度是否相符,過高酶在前幾個循環(huán)就迅速失活;過低則模板變性不徹底。反應系統(tǒng)中污染了蛋白酶及核酸酶,應在未加Taq酶以前,將反應體系95℃加熱5-10 min。引物變質失效。人工合成的引物是否正確。是否純化,或因儲存條件不當而失活。引物錯誤。利用BLAST檢查引物特異性或重新設計引物。 DNA凝膠電泳時加入陽性對照,確保不是DNA凝膠和PCR程序的問題。

聚合酶鏈反應允許快速生產(chǎn)短DN段,即使已知的引物序列不超過兩個。聚合酶鏈反應的這種能力增強了許多方法,例如生成雜交 探針用于 Southern 或northern blot 雜交。聚合酶鏈反應為這些技術提供了大量的純DNA,有時是單鏈的,甚至可以從非常少量的起始材料中進行分析。脫氧核糖核酸測序的任務也可以通過聚合酶鏈反應來輔助完成。已知的DN段可以很容易地從患有遺傳疾病突變的患者體內產(chǎn)生。對擴增技術的修飾可以從完全未知的基因組中提取片段,或者可以產(chǎn)生感興趣區(qū)域的單鏈。聚合酶鏈反應有許多應用于傳統(tǒng)的 DNA克隆。它可以從更大的基因組中提取片段以插入載體,這可能只有少量可用。使用一組“載體引物”,它還可以分析或提取已經(jīng)插入載體的片段。聚合酶鏈反應方案的一些改變可以產(chǎn)生突變(通用的或定點的)插入片段。聚合酶鏈式反應的引物與模板的結合及引物鏈的延伸是遵循堿基配對原則的。

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序列標簽站點是一個過程,其中PCR被用作基因組的特定片段存在于特定克隆中的指示物。人類基因組計劃發(fā)現(xiàn)這一應用對于繪制他們測序的粘??寺∫约皡f(xié)調不同實驗室的結果至關重要。聚合酶鏈反應的一個令人興奮的應用是對來自遠古來源的DNA進行系統(tǒng)進化分析,例如在尼安德特人的復原骨骼中、從猛犸的冷凍組織中或從埃及木乃伊的大腦中發(fā)現(xiàn)的DNA已經(jīng)被放大和測序。]在某些情況下,這些來源的高度降解的DNA可能在擴增的早期階段重新組裝。聚合酶鏈反應的一個常見應用是對以下基因表達模式的研究。組織(甚至單個細胞)可以在不同階段進行分析,以了解哪些基因變得活躍,哪些基因被關閉。該應用還可以使用定量聚合酶鏈反應來定量表達的實際水平。聚合酶鏈反應可以用于分析病癥、微生物或其他疾病狀態(tài)中基因表達水平的變化。南通分子生物學熒光定量PCR原理

聚合酶鏈反應可以選擇這些突變來理解蛋白質是如何完成其功能的,并改變或改善蛋白質功能。南通分子生物學熒光定量PCR原理

聚合酶鏈式反應:1976年,中國科學家,發(fā)現(xiàn)了穩(wěn)定的Taq DNA聚合酶,為PCR技術發(fā)展也做出了基礎性貢獻。PCR是利用DNA在體外攝氏95°高溫時變性會變成單鏈,低溫(經(jīng)常是60°C左右)時引物與單鏈按堿基互補配對的原則結合,標本核酸模板在提取過程中,由于吸樣污染導致標本間污染;有些微生物標本尤其是病毒可隨氣溶膠或形成氣溶膠而擴散再調溫度至DNA聚合酶很適反應溫度(72°C左右),DNA聚合酶沿著磷酸到五碳糖(5'-3')的方向合成互補鏈?;诰酆厦钢圃斓腜CR儀實際就是一個溫控設備,能在變性溫度,復性溫度,延伸溫度之間很好地進行控制。南通分子生物學熒光定量PCR原理