蘇州實時數(shù)字PCR原理

聚合酶鏈反應(yīng)的常見問題分析與解決方法：MgCl2濃度過高?？蛇m當降低其用量。模板量過多。質(zhì)粒DNA的用量應(yīng)<50 ng，而基因組DNA則應(yīng)<200 ng。引物濃度不夠優(yōu)化。對引物進行梯度稀釋重復(fù)PCR反應(yīng)。循環(huán)次數(shù)過多；增加模板量減少循環(huán)次數(shù)至30，縮短退火時間及延伸時間，或改用二種溫度的PCR循環(huán)。退火溫度過低。電泳體系有問題：凝膠中緩沖液和電泳緩沖液濃度相差太大；凝膠沒有凝固好；瓊脂糖質(zhì)量差。若為PCR試劑盒則可能：由于運輸儲存不當引起試劑盒失效；試劑盒本身質(zhì)量有問題，如引物選擇、循環(huán)參數(shù)等選擇不當。降解的陳舊模板擴增也易產(chǎn)生涂布。PCR產(chǎn)物的電泳檢測時間一般為48h以內(nèi)，有些很好于當日電泳檢測，大于48h后帶型不規(guī)則甚至消失。蘇州實時數(shù)字PCR原理

聚合酶鏈式：PCR由變性--退火--延伸三個基本反應(yīng)步驟構(gòu)成：模板DNA的變性：模板DNA經(jīng)加熱至93℃左右一定時間后，使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴增形成的雙鏈DNA解離，使之成為單鏈，以便它與引物結(jié)合，為下輪反應(yīng)作準備；模板DNA與引物的退火(復(fù)性)：模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后，溫度降至55℃左右，引物與模板DNA單鏈的互補序列配對結(jié)合；引物的延伸：DNA模板--引物結(jié)合物在TaqDNA聚合酶的作用下，以dNTP為反應(yīng)原料，靶序列為模板，按堿基配對與半保留復(fù)制原理，合成一條新的與模板DNA 鏈互補的半保留復(fù)制鏈重復(fù)循環(huán)變性--退火--延伸三過程，就可獲得更多的“半保留復(fù)制鏈”，而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。每完成一個循環(huán)需2-4分鐘，2-3小時就能將待擴目的基因擴增放大幾百萬倍。到達平臺期(Plateau)所需循環(huán)次數(shù)取決于樣品中模板的拷貝。　PCR技術(shù)敏感性高，特異性強，操作簡便、快速，在生命科學(xué)研究、食品衛(wèi)生、醫(yī)療、法醫(yī)及環(huán)境監(jiān)測等諸多方面都具有重要的應(yīng)用價值。蘇州實時數(shù)字PCR原理聚合酶鏈式反應(yīng)中要確保反應(yīng)緩沖液融化完全并徹底混勻。

PCR的反應(yīng)條件：dNTP濃度過高會加快反應(yīng)速度，但同時還可以增加堿基的錯誤摻入率。引物濃度過高會引起錯配和非特異性產(chǎn)物擴增。TaqDNA聚合酶濃度過高會引起錯配和非特異性產(chǎn)物擴增，低則合成產(chǎn)物量減少。TaqDNA聚合酶無校正功能，摻入錯誤率達2*E-4個核苷酸，一個30個循環(huán)的擴增反應(yīng)0.1%-0.25%總錯誤率。在90～95度下可使整個基因組的DNA變性為單鏈。一般94～95度30～60s。時間過長使TaqDNA聚合酶失活和dNTP破壞增多。DNA很快冷卻到40～60度使引物和模板結(jié)合。引物長度在15～25時退火溫度。

聚合酶鏈式反應(yīng)的常見問題：靶序列變異：如靶序列發(fā)生突變或缺失，影響引物與模板特異性結(jié)合，或因靶序列某 段缺失使引物與模板失去互補序列，其PCR擴增是不會成功的。假陽性：出現(xiàn)的PCR擴增條帶與目的靶序列條帶一致，有時其條帶更整齊，亮度更高。引物設(shè)計不合適：選擇的擴增序列與非目的擴增序列有同源性，因而在進行PCR擴增時，擴增出的PCR產(chǎn)物為非目的性的序列。靶序列太短或引物太短，容易出現(xiàn)假陽性。需重新設(shè)計引物。出現(xiàn)片狀拖帶或涂抹帶：PCR擴增有時出現(xiàn)涂抹帶或片狀帶或地毯樣帶。其原因往往由于酶量過多或酶的質(zhì)量差，dNTP濃度過高，Mg2+濃度過高，退火溫度過低，循環(huán)次數(shù)過多引起。其對策有：減少酶量，或調(diào)換另一來源的酶。②減少dNTP的濃度。適當降低Mg2+濃 度。增加模板量，減少循環(huán)次數(shù)。聚合酶鏈式反應(yīng)是80年代中期發(fā)展起來的體外核酸擴增技術(shù)。

聚合酶鏈反應(yīng)有許多優(yōu)點。它很容易理解和使用，并迅速產(chǎn)生結(jié)果。這項技術(shù)非常敏感，有可能產(chǎn)生數(shù)百萬到數(shù)十億份特定產(chǎn)品的拷貝，用于測序、克隆和分析。qRT-PCR具有與PCR相同的優(yōu)點，同時還具有定量合成產(chǎn)物的優(yōu)點。因此，它可以用于分析病癥、微生物或其他疾病狀態(tài)中基因表達水平的變化。聚合酶鏈反應(yīng)是一種非常強大和實用的研究工具。許多疾病的未知病因的測序正在通過聚合酶鏈反應(yīng)得到解決。這項技術(shù)可以幫助我們識別與已知病毒相關(guān)的未知病毒序列，從而讓我們更好地了解疾病本身。如果該過程可以進一步簡化，并且可以開發(fā)靈敏的非輻射檢測系統(tǒng)，PCR將在未來幾年在臨床實驗室中占據(jù)明顯地位。聚合酶鏈式反應(yīng)的引物與模板的結(jié)合及引物鏈的延伸是遵循堿基配對原則的。廣州特殊樣本數(shù)字PCR設(shè)計公司

流聚合酶鏈反應(yīng)：一種偽等溫PCR方法。蘇州實時數(shù)字PCR原理

聚合酶鏈式反應(yīng)PCR技術(shù)的基本原理類似于DNA的天然復(fù)制過程，其特異性依賴于與靶序列兩端互補的寡核苷酸引物。PCR由變性-退火-延伸三個基本反應(yīng)步驟構(gòu)成：模板DNA的變性：模板DNA經(jīng)加熱至93℃左右一定時間后，使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴增形成的雙鏈DNA解離，使之成為單鏈，以便它與引物結(jié)合，為下輪反應(yīng)作準備；模板DNA與引物的退火（復(fù)性）：模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后，溫度降至55℃左右，引物與模板DNA單鏈的互補序列配對結(jié)合；引物的延伸：DNA模板-引物結(jié)合物在72℃、DNA聚合酶（如TaqDNA聚合酶）的作用下，以dNTP為反應(yīng)原料，靶序列為模板，按堿基互補配對與半保留復(fù)制原理，合成一條新的與模板DNA鏈互補的半保留復(fù)制鏈，重復(fù)循環(huán)變性-退火-延伸三過程就可獲得更多的“半保留復(fù)制鏈”，而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。每完成一個循環(huán)需2～4分鐘，2～3小時就能將待擴目的基因擴增放大幾百萬倍。蘇州實時數(shù)字PCR原理