RNA病毒二代測序技術(shù)

病毒是由一種核酸分子（DNA或RNA）與蛋白質(zhì)（Protein）構(gòu)成或只由蛋白質(zhì)構(gòu)成（如朊病毒）。根據(jù)遺傳物質(zhì)的組成，可分為單鏈DNA病毒（ssDNA）、雙鏈DNA病毒（dsDNA）、單鏈RNA病毒（ssRNA）、雙鏈RNA病毒（dsRNA）和蛋白質(zhì)病毒（如朊病毒）。根據(jù)宿主類型的不同，可以分為噬菌體（細(xì)菌病毒）、植物病毒（煙花葉病毒）和動(dòng)物病毒（如禽流感病毒、天花病毒和HIV等）。病毒全基因組測序（VirusWholeGenomeSequencing，VWGS），是指基于第二代高通量測序技術(shù)，對病毒全基因組進(jìn)行測序，利用生物信息分析手段，得到病毒的全基因組序列，解析編碼信息，并獲得相應(yīng)的變異信息。DNA病毒基因組測序：一種指定DNA病毒盡量完整的序列。RNA病毒二代測序技術(shù)

病毒基因組測序是疾病診斷、流行病學(xué)調(diào)查和宿主-病原關(guān)系研究的重要手段。病毒的全基因組測序以及對應(yīng)的生物信息學(xué)分析方法是研究病毒進(jìn)化、毒力因子變異、疫病爆發(fā)之間的關(guān)系、疫病傳播途徑、不同遺傳變異的分布模式、疫病發(fā)生地理區(qū)域的基礎(chǔ)。與傳統(tǒng)Sanger測序相比，NGS技術(shù)的發(fā)展使得一個(gè)小的研究小組可以擁有大量病毒株的全基因組序列，測序成本也在逐步降低。由于NGS產(chǎn)生的數(shù)據(jù)量非常龐大，其序列拼接難度也隨之增加。而且對于低濃度高復(fù)雜度的樣本，研究者除了PCR外別無他法。而PCR方法往往具有偏好性，丟失的片段將為序列組裝帶來非常高的失敗率。對于完全未知的樣本，無法通過PCR進(jìn)行富集，要鑒定其種類需要調(diào)用各種方法，逐個(gè)嘗試，工作量之大，其效率之低，使得一個(gè)新的研究方法的出現(xiàn)及其必要。國內(nèi)病毒序列原理病原學(xué)的診斷始終是傳染性疾病診斷的重要一環(huán)。

測序技術(shù)：在病毒的鑒定及診斷中，通過高通量測序技術(shù)和RT-PCR方法的聯(lián)合使用，可以實(shí)現(xiàn)優(yōu)勢互補(bǔ)，提高陽性檢出率。更為重要的是，利用高通量測序技術(shù)還可以對病毒序列進(jìn)行組裝，獲得病毒全長基因組信息，為監(jiān)測病毒變異、探究致病機(jī)理提供研究基礎(chǔ)。本次報(bào)告將圍繞高通量測序技術(shù)在檢測中的方法和策略展開分享。高通量測序技術(shù)的飛速發(fā)展使其在病毒學(xué)研究領(lǐng)域得到了越來越普遍的應(yīng)用。無論是突發(fā)病情的應(yīng)急處理、新病毒的發(fā)現(xiàn),還是較大規(guī)模的分子流行病調(diào)查,高通量測序技術(shù)都比一代測序技術(shù)有著巨大的優(yōu)勢。SFTS病毒（SFTSvirus,SFTSV）是2009年在中國新發(fā)現(xiàn)的一種布尼亞科白蛉病毒屬的蜱傳病毒,為新發(fā)傳染病發(fā)熱伴血小板減少綜合征（Severefeverwiththrombocytopeniasyndrome,SFTS）致病病因,現(xiàn)在在中國至少20個(gè)省流行。

人類的病毒性傳染很普遍，病毒可以通過呼吸道、消化道、皮膚等多種途徑進(jìn)行傳播，常常會(huì)導(dǎo)致嚴(yán)重的公共健康問題，對人類的健康造成威脅。傳統(tǒng)的病毒檢測方法主要依賴于細(xì)胞培養(yǎng)法、抗原抗體結(jié)合法等，這些方法耗時(shí)久，靈敏度低，往往不能夠滿足臨床檢測需求。隨著分子生物學(xué)的發(fā)展，PCR方法用于病毒檢測的案例越來越多，但該方法的特異性限制了其同時(shí)檢測其它病毒的能力。因此，需要通過新的技術(shù)來實(shí)現(xiàn)。隨著二代測序技術(shù)成本的降低與普及，二代測序在臨床病原體檢測方面的優(yōu)勢也越加突顯。該技術(shù)基于二代測序平臺，可以直接從樣本中獲得病原體的核酸序列信息，再通過生物信息學(xué)的方法對得到的序列進(jìn)行分析，可以快速地對樣本中可能存在的全部病原體進(jìn)行鑒定，縮短了臨床檢測的周期。病毒全基因組測序產(chǎn)品特點(diǎn)：對采集臨床樣本直接檢測。

病毒全基因組測序在政策促進(jìn)下，未來3—5年內(nèi)，我國將在醫(yī)藥、保養(yǎng)短缺地區(qū)建設(shè)一批高水平臨床醫(yī)治中心、高層次的人才培養(yǎng)基地和高水平的科研創(chuàng)新與轉(zhuǎn)化平臺，培育一批品牌優(yōu)勢明顯、跨區(qū)域提供高水平服務(wù)的集團(tuán)。根據(jù)病毒測序，病毒全基因組測序，病毒宏基因組測序，未知病原鑒定相關(guān)領(lǐng)域極新技術(shù)發(fā)展趨勢，《2019年本》在鼓勵(lì)類條目中新增了技術(shù)開發(fā)和應(yīng)用的有關(guān)內(nèi)容。例如，在化學(xué)原料藥領(lǐng)域增加了“連續(xù)反應(yīng)”等技術(shù)，在技術(shù)領(lǐng)域增加了“基因醫(yī)治”和“抗體偶聯(lián)”等技術(shù)，在藥用包裝材料領(lǐng)域增加了“中性硼硅藥用玻璃”等材料與技術(shù)的開發(fā)應(yīng)用，在醫(yī)藥領(lǐng)域增加了“人工智能輔助醫(yī)藥設(shè)備”等新技術(shù)內(nèi)容。病毒全基因組測序要注意什么事項(xiàng)？DNA深度測序進(jìn)化分析服務(wù)

病毒株都需要獲得盡量完整的基因組序列來指導(dǎo)下一步的研究。RNA病毒二代測序技術(shù)

對病毒的全基因組進(jìn)行測序的價(jià)格合理，樣品具備什么條件才可以獲得比較質(zhì)量的組裝效果？其他公司對用于測序的樣本的要求較高。探普生物對病毒的全基因組進(jìn)行測序是基于探普的專有流程，樣本要求非常低，不要求粒子純化，不要求總量到達(dá)微克，按探普的專門的收樣標(biāo)準(zhǔn)和送樣流程進(jìn)行即可。簡言之，經(jīng)過細(xì)胞或其他方式培養(yǎng)的樣本，若載量較高，不需要復(fù)雜處理，直接破碎細(xì)胞取上清提取核酸都可以獲得非常好的組裝效果；而臨床標(biāo)本，需要看情況，對于被侵害嚴(yán)重的個(gè)體，釋放較高的部位也可以獲得很好的效果；其他類型的樣本，就需要測ct值來確定是否可以進(jìn)行實(shí)驗(yàn)，以及評估測序效果。RNA病毒二代測序技術(shù)

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