國內(nèi)深度測序分析方法

病毒基因組的結(jié)構(gòu)特點有哪些？病毒基因組大小相差較大。病毒基因組可以由DNA組成，也可以由RNA組成。多數(shù)RNA病毒的基因組是由連續(xù)的核糖核酸鏈組成，還沒有發(fā)現(xiàn)有節(jié)段性的DNA分子構(gòu)成的病毒基因組。病毒基因組的大部分是用來編碼蛋白質(zhì)的。病毒基因組DNA序列能上相關(guān)的蛋白質(zhì)的基因或rRNA的基因往往叢集在基因組的一個或幾個特定的部位,形成一個功能單位或轉(zhuǎn)錄單元。除了反轉(zhuǎn)錄病毒以外一切病毒基因組都是單倍體，每個基因在病毒顆粒中只出現(xiàn)一次。噬菌體（細菌病毒）的基因是連續(xù)的；而真核細胞病毒的基因是不連續(xù)的，具有內(nèi)含子。高通量測序技術(shù)正式啟用之后，研究者可以將樣品處理至標準濃度和體積后進行測序和分析。國內(nèi)深度測序分析方法

深度測序與個性化醫(yī)學(xué)的范式相比，P4醫(yī)學(xué)更強調(diào)早期預(yù)測和預(yù)防，強調(diào)對患者了解的系統(tǒng)性和參與性。準確醫(yī)學(xué)的概念則是在基因測序普及的基礎(chǔ)上，將整個個體的各種信息如生理信息（通過可穿戴設(shè)備可以即時監(jiān)控和收集到）和腸道菌群變化、各種組學(xué)信息（深度測序測定）整合，進行準確的疾病分型、調(diào)整和預(yù)防。隨著老年化時代的到來及臨床資源的限制，基于這三種范式的健康管理和準確診療將成為生物醫(yī)學(xué)研究與應(yīng)用的基本范式，走向大眾生活，正如當年的計算機發(fā)展歷程一樣，會從原來的大型機器演變成可移動的小型工具。醫(yī)學(xué)與健康的將來也會隨著深度測序的普及和生物信息學(xué)數(shù)據(jù)處理能力的大幅度提高，而進入個性化的大眾管理時代。國內(nèi)全基因組病毒分析公司高通量測序技術(shù)正式啟用之后，研究者可以將樣品處理至標準濃度和體積后進行測序和分析.

哪些應(yīng)用場景需要對病毒的全基因組進行測序？在探普生物長時間運行過程中，我們接觸到的對病毒的全基因組進行測序項目有比較豐富的應(yīng)用場景。先，從事基因進化/疫苗/藥品/抗體研制方向的研究的研究者一定會用到測序。這種場景一般是用密集的sanger測序監(jiān)測某幾個關(guān)鍵基因，搭載一定頻率的全基因組測序。這樣的組合省時省力省經(jīng)費，同時能達到研究目的。此外，有的單位需要對傳染病的病原進行流行病學(xué)監(jiān)測和研究，如疾控/疫控中心、醫(yī)院的傳染病科室以及一些高校和研究所的相應(yīng)課題組，可能需要對病毒的全基因組進行測序以后，結(jié)合其他上下游的研究數(shù)據(jù)，達到研究或者監(jiān)測疫病的目的。

一直以來，病毒基因組測序都是疾病診斷、流行病學(xué)調(diào)查和宿主-病原關(guān)系研究的重要手段。病毒的全基因組測序以及對應(yīng)的生物信息學(xué)分析方法是研究病毒進化、毒力因子變異、疫病爆發(fā)之間的關(guān)系、疫病傳播途徑、不同遺傳變異的分布模式、疫病發(fā)生地理區(qū)域的基礎(chǔ)。與傳統(tǒng)Sanger測序相比，NGS技術(shù)的發(fā)展使得一個小的研究小組可以擁有大量病毒株的全基因組序列，測序成本也在逐步降低。由于NGS產(chǎn)生的數(shù)據(jù)量非常龐大，其序列拼接難度也隨之增加。而且對于低濃度高復(fù)雜度的樣本，研究者除了PCR外別無他法。而PCR方法往往具有偏好性，丟失的片段將為序列組裝帶來非常高的失敗率。對于完全未知的樣本，無法通過PCR進行富集，要鑒定其種類需要調(diào)用各種方法，逐個嘗試，工作量之大，其效率之低，使得一個新的研究方法的出現(xiàn)及其必要。探普生物獨有的實驗和分析流程，可兼容高復(fù)雜度，低濃度的病毒核酸。

    有哪些技術(shù)手段能實現(xiàn)對病毒的全基因組進行測序呢？早期在高通量測序技術(shù)普及之前，對病毒的全基因組進行測序是通過非特異性擴增+克隆結(jié)合sanger測序來完成的。當物種有了參考的序列之后，可以通過特異性擴增+sanger測序獲得全基因組序列。Sanger測序準確度高，讀長很長，但與此同時，擴增和克隆工作費時費力，由于流程繁瑣，加上快速變異導(dǎo)致引物無法通用，該方法對于大量基因組的測序工作而言，可操作性不強，這對于研究者一直是一個困擾。高通量測序技術(shù)正式啟用之后，研究者可以將樣品處理至標準濃度和體積后進行測序和分析，減少了工作量，增加了成功率。探普生物進行了大量有針對性的研發(fā)和測試，開發(fā)了全套的實驗和分析流程用于對病毒的全基因組進行測序，該流程自運行以來廣受研究者們好評。 探普生物病毒測序具備樣本準備簡單的優(yōu)點。北京病毒測序突變分析上哪找

想要通過高通量測序獲得病毒全序列，需要經(jīng)歷:核酸純化-文庫構(gòu)建-生物信息學(xué)分析這三大基本流程.國內(nèi)深度測序分析方法

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