國內(nèi)全基因組二代測序方法

在哪些應(yīng)用場景需要對病毒的全基因組進行測序？在探普生物長時間運行過程中，我們接觸到的對病毒的全基因組進行測序項目有比較豐富的應(yīng)用場景。先，從事基因進化/疫苗/藥品/抗體研制方向的研究的研究者一定會用到測序。這種場景一般是用密集的sanger測序監(jiān)測某幾個關(guān)鍵基因，搭載一定頻率的全基因組測序。這樣的組合省時省力省經(jīng)費，同時能達到研究目的。此外，有的單位需要對傳染病的病原進行流行病學(xué)監(jiān)測和研究，如疾控/疫控中心、醫(yī)院的傳染病科室以及一些高校和研究所的相應(yīng)課題組，可能需要對病毒的全基因組進行測序以后，結(jié)合其他上下游的研究數(shù)據(jù)，達到研究或者監(jiān)測疫病的目的。高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次性的改變。國內(nèi)全基因組二代測序方法

深度測序技術(shù)對科學(xué)研究范式相關(guān)影響：個性化醫(yī)學(xué)、P4醫(yī)學(xué)和準確醫(yī)學(xué)等研究范式都是在近幾年深度測序技術(shù)迅猛發(fā)展的基礎(chǔ)上提出的。個人基因組測定的可行性，使得大眾有可能測定和分析自己的基因組、尋找到個人健康相關(guān)的基因風(fēng)險因素，從而可以在生活習(xí)慣、飲食等方面提早進行個性化預(yù)測和預(yù)防。由于互聯(lián)網(wǎng)的發(fā)展和即時檢驗技術(shù)（point-of-care-testing，POCT）的應(yīng)用，人們可以通過網(wǎng)絡(luò)進行交流和參與到整個診療過程，這便是P4醫(yī)學(xué)的概念：預(yù)測性（predictive）、預(yù)防性（preventive）、個性化（personalized）及參與性（participatory）。北京高通量測序分析服務(wù)探普生物進行了大量有針對性的研發(fā)和測試，開發(fā)了全套的實驗和分析流程用于對病毒的全基因組進行測序。

全基因組測序是對未知基因組序列的物種進行個體的基因組測序。全基因組預(yù)測的意義揭示了人類生、老、病和死的奧秘，使人類從根本上認知疾病發(fā)生的原因，做到正確的調(diào)整疾病和盡早的預(yù)防疾病。每個人從開始就繼承了父母的DNA遺傳信息，并且攜帶一生，不易改變。全基因組測序通過運用新一代高通量DNA測序儀，進行10到20倍覆蓋率的個人全基因組測序，然后與人類基因組精確圖譜比較，得到完整的個人全基因組序列，破譯個人全部的遺傳信息的過程。全基因組測序覆蓋面廣，能檢測個體基因組中的全部遺傳信息，準確性高。

在探普生物長時間運行過程中，我們接觸到的對病毒的全基因組進行測序項目有比較豐富的應(yīng)用場景。先，從事基因進化/疫苗/藥品/抗體研制方向的研究的研究者一定會用到測序。這種場景一般是用密集的sanger測序監(jiān)測某幾個關(guān)鍵基因，搭載一定頻率的全基因組測序。這樣的組合省時省力省經(jīng)費，同時能達到研究目的。此外，有的單位需要對傳染病的病原進行流行病學(xué)監(jiān)測和研究，如疾控/疫控中心、醫(yī)院的傳染病科室以及一些高校和研究所的相應(yīng)課題組，可能需要對病毒的全基因組進行測序以后，結(jié)合其他上下游的研究數(shù)據(jù)，達到研究或者監(jiān)測疫病的目的。病毒全基因組測序具有的特點：完善的售后服務(wù)。

深度測序技術(shù)稱為深度測序（deepsequencing），是因為它是對傳統(tǒng)測序技術(shù)的一次性改變，它通過一次性對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定（之前只是幾十至多幾千個堿基），同時，如此的高通量測序使得對一個物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進行細致全方面的分析成為可能。你以為深度測序只是一種“養(yǎng)”在實驗室“深閨”中摸不著、看不透的高精尖技術(shù)？錯！錯！錯！深度測序技術(shù)的巨大發(fā)展，與計算機的發(fā)展歷程有著類似之處，它將對人類的科學(xué)、經(jīng)濟和社會三個方面產(chǎn)生深遠的影響。病毒株往往都需要獲得盡量完整的基因組序列來指導(dǎo)下一步的研究。國內(nèi)全基因組二代測序方法

病毒基因組測序是疾病診斷、流行病學(xué)調(diào)查和宿主-病原關(guān)系研究的重要手段。國內(nèi)全基因組二代測序方法

一直以來，病毒基因組測序都是疾病診斷、流行病學(xué)調(diào)查和宿主-病原關(guān)系研究的重要手段。病毒的全基因組測序以及對應(yīng)的生物信息學(xué)分析方法是研究病毒進化、毒力因子變異、疫病爆發(fā)之間的關(guān)系、疫病傳播途徑、不同遺傳變異的分布模式、疫病發(fā)生地理區(qū)域的基礎(chǔ)。與傳統(tǒng)Sanger測序相比，NGS技術(shù)的發(fā)展使得一個小的研究小組可以擁有大量病毒株的全基因組序列，測序成本也在逐步降低。由于NGS產(chǎn)生的數(shù)據(jù)量非常龐大，其序列拼接難度也隨之增加。而且對于低濃度高復(fù)雜度的樣本，研究者除了PCR外別無他法。而PCR方法往往具有偏好性，丟失的片段將為序列組裝帶來非常高的失敗率。對于完全未知的樣本，無法通過PCR進行富集，要鑒定其種類需要調(diào)用各種方法，逐個嘗試工作量之大，其效率之低，使得一個新的研究方法的出現(xiàn)及其必要。國內(nèi)全基因組二代測序方法

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