高通量測(cè)序突變分析方法

深度測(cè)序技術(shù)稱(chēng)為深度測(cè)序（deepsequencing），是因?yàn)樗菍?duì)傳統(tǒng)測(cè)序技術(shù)的一次性改變，它通過(guò)一次性對(duì)幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定（之前只是幾十至多幾千個(gè)堿基），同時(shí)，如此的高通量測(cè)序使得對(duì)一個(gè)物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進(jìn)行細(xì)致全方面的分析成為可能。你以為深度測(cè)序只是一種“養(yǎng)”在實(shí)驗(yàn)室“深閨”中摸不著、看不透的高精尖技術(shù)？錯(cuò)！錯(cuò)！錯(cuò)！深度測(cè)序技術(shù)的巨大發(fā)展，與計(jì)算機(jī)的發(fā)展歷程有著類(lèi)似之處，它將對(duì)人類(lèi)的科學(xué)、經(jīng)濟(jì)和社會(huì)三個(gè)方面產(chǎn)生深遠(yuǎn)的影響。病毒是由一種核酸分子與蛋白質(zhì)構(gòu)成或只由蛋白質(zhì)構(gòu)成。高通量測(cè)序突變分析方法

有哪些技術(shù)手段能實(shí)現(xiàn)對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序？早期在高通量測(cè)序技術(shù)普及之前，對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序是通過(guò)非特異性擴(kuò)增+克隆結(jié)合sanger測(cè)序來(lái)完成的。當(dāng)物種有了參考的序列之后，可以通過(guò)特異性擴(kuò)增+sanger測(cè)序獲得全基因組序列。Sanger測(cè)序準(zhǔn)確度高，讀長(zhǎng)很長(zhǎng)，但與此同時(shí)，擴(kuò)增和克隆工作費(fèi)時(shí)費(fèi)力，由于流程繁瑣，加上快速變異導(dǎo)致引物無(wú)法通用，該方法對(duì)于大量基因組的測(cè)序工作而言，可操作性不強(qiáng)，這對(duì)于研究者一直是一個(gè)困擾。高通量測(cè)序技術(shù)正式啟用之后，研究者可以將樣品處理至標(biāo)準(zhǔn)濃度和體積后進(jìn)行測(cè)序和分析，減少了工作量，增加了成功率。探普生物進(jìn)行了大量有針對(duì)性的研發(fā)和測(cè)試，開(kāi)發(fā)了全套的實(shí)驗(yàn)和分析流程用于對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序，該流程自運(yùn)行以來(lái)廣受研究者們好評(píng)。高通量測(cè)序突變分析方法在探普生物長(zhǎng)時(shí)間運(yùn)行過(guò)程中，接觸到的對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序項(xiàng)目有比較豐富的應(yīng)用場(chǎng)景。

深度測(cè)序技術(shù)之所以稱(chēng)為深度測(cè)序（deepsequencing），是因?yàn)樗菍?duì)傳統(tǒng)測(cè)序技術(shù)的一次性改變，它通過(guò)一次性對(duì)幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定（之前只是幾十至多幾千個(gè)堿基），同時(shí)，如此的高通量測(cè)序使得對(duì)一個(gè)物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進(jìn)行細(xì)致全方面的分析成為可能。你以為深度測(cè)序只是一種“養(yǎng)”在實(shí)驗(yàn)室“深閨”中摸不著、看不透的高精尖技術(shù)？錯(cuò)！錯(cuò)！錯(cuò)！深度測(cè)序技術(shù)的巨大發(fā)展，與計(jì)算機(jī)的發(fā)展歷程有著類(lèi)似之處，它將對(duì)人類(lèi)的科學(xué)、經(jīng)濟(jì)和社會(huì)三個(gè)方面產(chǎn)生深遠(yuǎn)的影響。

二代測(cè)序可以用于對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序有哪些挑戰(zhàn)？二代測(cè)序相較sanger測(cè)序，差異主要就是單次運(yùn)行可以獲得海量的數(shù)據(jù)量，因此也稱(chēng)為高通量測(cè)序。想要通過(guò)高通量測(cè)序獲得病毒全序列，需要經(jīng)歷：核酸純化-文庫(kù)構(gòu)建-生物信息學(xué)分析這三大基本流程。而高通量測(cè)序技術(shù)本身并不是以病毒為目標(biāo)開(kāi)發(fā)的，因此每個(gè)環(huán)節(jié)都是挑戰(zhàn)。核酸純化步驟決定了Input核酸的起始濃度和總量，從而決定了文庫(kù)構(gòu)建的成敗、質(zhì)量和產(chǎn)量；文庫(kù)的好壞決定了數(shù)據(jù)的質(zhì)量和產(chǎn)出；而數(shù)據(jù)的質(zhì)量產(chǎn)出直接影響分析結(jié)果。樣品一般核酸濃度很低，且?guī)в写罅克拗魑廴?，因此?shí)驗(yàn)部分和分析部分都比較困難。探普生物基于這些困難點(diǎn)，進(jìn)行了大量有針對(duì)性的研發(fā)和測(cè)試，開(kāi)發(fā)了全套的實(shí)驗(yàn)和分析流程用于對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序，該流程自運(yùn)行以來(lái)廣受研究者們好評(píng)。病毒全基因組測(cè)序具有的特點(diǎn)：無(wú)需培養(yǎng)和特異性擴(kuò)增，對(duì)采集臨床樣本直接檢測(cè)。

病毒全基因組測(cè)序定：上海探普生物科技有限公司的對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序有什么優(yōu)勢(shì)？全國(guó)開(kāi)設(shè)病毒相關(guān)測(cè)序的公司不超過(guò)5家，只有探普生物是專(zhuān)門(mén)為病毒研究者服務(wù)的，探普生物的研發(fā)團(tuán)隊(duì)和實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)都來(lái)自全國(guó)各地病毒學(xué)、微生物學(xué)專(zhuān)業(yè)的高校，碩士及以上學(xué)歷成員超過(guò)60%，團(tuán)隊(duì)具備普通測(cè)序?qū)嶒?yàn)和分析基礎(chǔ)之外，同時(shí)具備病毒學(xué)及微生物學(xué)的學(xué)術(shù)背景，相當(dāng)了解病毒相關(guān)樣本情況、研究方向等。研究者在項(xiàng)目咨詢(xún)的時(shí)候就可以明顯感覺(jué)到探普生物的專(zhuān)業(yè)性，溝通順暢，省時(shí)省力。通過(guò)對(duì)病毒全基因組高通量測(cè)序可以在較短時(shí)間內(nèi)獲取病毒的全部基因信息，解釋病毒的來(lái)源。RNA病毒全基因組二代測(cè)序分析技術(shù)

二代測(cè)序可以用于對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序有哪些挑戰(zhàn)？高通量測(cè)序突變分析方法

RNA病毒基因組測(cè)序：動(dòng)物、人、植物被特定病毒株侵染、分離到病毒株、連續(xù)傳代的病毒株往往都需要獲得盡量完整的基因組序列來(lái)指導(dǎo)下一步的研究，傳統(tǒng)的sanger測(cè)序需要了解序列、設(shè)計(jì)引物、做很多PCR，往往效率很低，而NGS作為一種無(wú)需特異性引物擴(kuò)增的測(cè)序方式，可以直接從RNA中獲得序列。如果，1，您的目的是：獲得一種指定RNA病毒盡量完整的序列；2，您可以提供該病毒的中英文名稱(chēng)；3，您了解樣本中病毒的載量情況、培養(yǎng)狀況、ct值等任一信息。那么，RNA病毒基因組測(cè)序可以幫助你，探普為你準(zhǔn)備了完整的下單、樣本準(zhǔn)備方法。高通量測(cè)序突變分析方法