DNA病毒高通量測序進(jìn)化分析哪家好

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-04-02

有哪些技術(shù)手段能實(shí)現(xiàn)對病毒的全基因組進(jìn)行測序?早期在高通量測序技術(shù)普及之前,對病毒的全基因組進(jìn)行測序是通過非特異性擴(kuò)增+克隆結(jié)合sanger測序來完成的。當(dāng)物種有了參考的序列之后,可以通過特異性擴(kuò)增+sanger測序獲得全基因組序列。Sanger測序準(zhǔn)確度高,讀長很長,但與此同時(shí),擴(kuò)增和克隆工作費(fèi)時(shí)費(fèi)力,由于流程繁瑣,加上快速變異導(dǎo)致引物無法通用,該方法對于大量基因組的測序工作而言,可操作性不強(qiáng),這對于研究者一直是一個(gè)困擾。高通量測序技術(shù)正式啟用之后,研究者可以將樣品處理至標(biāo)準(zhǔn)濃度和體積后進(jìn)行測序和分析,減少了工作量,增加了成功率。探普生物進(jìn)行了大量有針對性的研發(fā)和測試,開發(fā)了全套的實(shí)驗(yàn)和分析流程用于對病毒的全基因組進(jìn)行測序,該流程自運(yùn)行以來廣受研究者們好評。病毒基因組測序包括完成圖測序、掃描圖測序和重測序幾個(gè)層面。DNA病毒高通量測序進(jìn)化分析哪家好

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病毒全基因組測序具有的特點(diǎn):1.不預(yù)設(shè)目標(biāo)檢出物,樣本的所有病原信息一網(wǎng)打盡;2.無需培養(yǎng)和特異性擴(kuò)增,對采集臨床樣本直接檢測;3.獨(dú)有的一定定量技術(shù),實(shí)現(xiàn)病原定量分析,使病原診斷更準(zhǔn)確;4.與臨床各領(lǐng)域有名**共同打造呼吸道系統(tǒng)、神經(jīng)內(nèi)科系統(tǒng)和血流系統(tǒng)傳染病原數(shù)據(jù)庫,更加貼合需求;5.采用高通量測序儀,全流程質(zhì)控,結(jié)果穩(wěn)定可靠;6.整體檢出率陽性率較傳統(tǒng)方法提升25~30%:肺泡灌洗液檢出率60~80%,腦脊液檢出率40~60%,血液檢出率40~60%;7.專業(yè)化服務(wù):臨床微生物**出具報(bào)告,專業(yè)醫(yī)學(xué)團(tuán)隊(duì)報(bào)告解讀。針對疑難報(bào)告,由**進(jìn)行深度解析;8.完善的售后服務(wù):基于PCR技術(shù)和抗原抗體技術(shù)的售后驗(yàn)證平臺(tái),致力于解決臨床的每一個(gè)疑問。DNA病毒高通量測序進(jìn)化分析哪家好病毒全基因組測序產(chǎn)品特點(diǎn):樣本的所有病原信息一網(wǎng)打盡。

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病毒基因組測序:病毒基因組測序包括完成圖測序、掃描圖測序和重測序三個(gè)層面,通過二代/三代測序平臺(tái),獲得病毒的基因組的序列信息,并在結(jié)構(gòu)基因組學(xué)、比較基因組學(xué)層面通過差異分析、同源基因分析、共線性分析、物種進(jìn)化分析等手段探究病毒的毒力系統(tǒng)、基因組的進(jìn)化與演變歷程等。對疑似傳染標(biāo)本采集提取后直接進(jìn)行高通量測序,通過病原微生物專門用的數(shù)據(jù)庫比對和智能化算法分析,獲得疑似致病微生物種屬信息,并提供全方面深入的報(bào)告,為疑難危重傳染提供快速準(zhǔn)確診斷依據(jù),促進(jìn)藥物的合理應(yīng)用。

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深度測序技術(shù)之所以稱為深度測序(deepsequencing),是因?yàn)樗菍鹘y(tǒng)測序技術(shù)的一次性改變,它通過一次性對幾十萬到幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測定(之前只是幾十至多幾千個(gè)堿基),同時(shí),如此的高通量測序使得對一個(gè)物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進(jìn)行細(xì)致全方面的分析成為可能。你以為深度測序只是一種“養(yǎng)”在實(shí)驗(yàn)室“深閨”中摸不著、看不透的高精尖技術(shù)?錯(cuò)!錯(cuò)!錯(cuò)!深度測序技術(shù)的巨大發(fā)展,與計(jì)算機(jī)的發(fā)展歷程有著類似之處,它將對人類的科學(xué)、經(jīng)濟(jì)和社會(huì)三個(gè)方面產(chǎn)生深遠(yuǎn)的影響。Sanger測序準(zhǔn)確度高,讀長很長。病毒二代測序突變分析要多久

病原學(xué)的診斷始終是傳染性疾病診斷的重要一環(huán)。DNA病毒高通量測序進(jìn)化分析哪家好

在探普生物長時(shí)間運(yùn)行過程中,我們接觸到的對病毒的全基因組進(jìn)行測序項(xiàng)目有比較豐富的應(yīng)用場景。先,從事基因進(jìn)化/疫苗/藥品/抗體研制方向的研究的研究者一定會(huì)用到測序。這種場景一般是用密集的sanger測序監(jiān)測某幾個(gè)關(guān)鍵基因,搭載一定頻率的全基因組測序。這樣的組合省時(shí)省力省經(jīng)費(fèi),同時(shí)能達(dá)到研究目的。此外,有的單位需要對傳染病的病原進(jìn)行流行病學(xué)監(jiān)測和研究,如疾控/疫控中心、醫(yī)院的傳染病科室以及一些高校和研究所的相應(yīng)課題組,可能需要對病毒的全基因組進(jìn)行測序以后,結(jié)合其他上下游的研究數(shù)據(jù),達(dá)到研究或者監(jiān)測疫病的目的。DNA病毒高通量測序進(jìn)化分析哪家好

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