上海蛋白免疫沉淀磁珠哪個(gè)公司好用

來源: 發(fā)布時(shí)間:2024-06-04

ChIP(染色質(zhì)免疫沉淀)實(shí)驗(yàn)是一種用于研究蛋白質(zhì)與DNA相互作用的技術(shù)。以下是ChIP實(shí)驗(yàn)的實(shí)驗(yàn)方法概述:
1. 交聯(lián):將細(xì)胞與交聯(lián)劑(如1%甲醛)孵育,通常在室溫下進(jìn)行10-15分鐘。
2. 終止交聯(lián):添加甘氨酸以終止交聯(lián)反應(yīng),孵育5分鐘。
3. 收集細(xì)胞:通過離心收集細(xì)胞,并用PBS洗滌以去除交聯(lián)劑。
4. 細(xì)胞裂解:使用裂解緩沖液裂解細(xì)胞,釋放染色質(zhì)。
5. 染色質(zhì)剪切:使用超聲波或酶消化將染色質(zhì)剪切成適當(dāng)大小的片段。
6. 免疫沉淀:將剪切后的染色質(zhì)與特異性抗體孵育,然后添加蛋白A/G磁珠。
7. 洗滌:用低鹽、高鹽和LiCl洗滌液洗滌磁珠,去除非特異性結(jié)合物。
8. 洗脫:用洗脫緩沖液洗脫DNA。
9. 逆轉(zhuǎn)交聯(lián):用蛋白酶K處理,然后在65°C下加熱過夜以逆轉(zhuǎn)交聯(lián)。
10. DNA純化:使用商業(yè)試劑盒或標(biāo)準(zhǔn)酚/氯仿方法純化DNA。
11. 分析:使用qPCR分析富集的DNA,或進(jìn)行測(cè)序以確定蛋白質(zhì)結(jié)合位點(diǎn)。
免疫沉淀選瓊脂糖珠還是磁珠?上海蛋白免疫沉淀磁珠哪個(gè)公司好用

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RIP(RNA Immunoprecipitation,RNA免疫沉淀)的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)需要考慮多個(gè)方面,以確保實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)確性和可重復(fù)性。
1. 目標(biāo)蛋白的選擇:確定你想要研究的目標(biāo)RNA結(jié)合蛋白(RBP)。
2. 陽性和陰性對(duì)照:設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)時(shí),需要包括陽性對(duì)照和陰性對(duì)照。
3. 細(xì)胞培養(yǎng)與裂解:選擇合適的細(xì)胞類型進(jìn)行培養(yǎng)。
4. 抗體孵育:將特異性抗體與細(xì)胞裂解液孵育,以形成抗體-蛋白質(zhì)-RNA復(fù)合物。
5. 免疫沉淀:使用蛋白A或蛋白G結(jié)合的珠子進(jìn)行免疫沉淀,捕獲抗體-蛋白質(zhì)-RNA復(fù)合物。
6. 洗滌和分離:洗滌珠子以去除未特異性結(jié)合的蛋白質(zhì)和RNA。從珠子上分離RNA,可能需要使用低pH緩沖液或蛋白酶K處理。
7. RNA分析:使用qPCR、Northern blot或RNA-Seq等方法分析沉淀下來的RNA。
8. 數(shù)據(jù)分析:對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行定量分析,比較不同樣品之間的RNA水平。

9. 實(shí)驗(yàn)重復(fù):為了確保結(jié)果的可靠性,實(shí)驗(yàn)應(yīng)該進(jìn)行至少三次重復(fù)。 北京RIP免疫沉淀實(shí)驗(yàn)原理免疫沉淀技術(shù)RIP的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)。

10. 技術(shù)驗(yàn)證:使用其他技術(shù)(如RNA-pull down或FISH)驗(yàn)證RIP實(shí)驗(yàn)結(jié)果。
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免疫沉淀實(shí)驗(yàn)中磁珠還是瓊脂糖珠的選擇取決于客戶實(shí)驗(yàn)情況。
瓊脂糖珠海綿狀的結(jié)構(gòu)  (直徑 50-150 μm)  可以結(jié)合抗體  (繼而結(jié)合靶蛋白) ,它能夠直接高效、快速結(jié)合抗體,而不需借助特殊的專業(yè)設(shè)備。瓊脂糖珠呈多孔結(jié)構(gòu),這使得它們擁有更大的表面積可與蛋白質(zhì)相互接觸,具有更高的結(jié)合載量。
與瓊脂糖珠不同,磁珠是固體,抗體的結(jié)合限于磁珠的表面。磁珠 (直徑 1-4 μm) 明顯小于瓊脂糖珠 ,盡管磁珠沒有多孔中心增加結(jié)合能力,但每體積的磁珠數(shù)量比瓊脂糖珠多,使磁珠擁有足夠的抗體結(jié)合表面積滿足高容量的抗體結(jié)合。
簡(jiǎn)而言之,瓊脂糖珠的結(jié)合能力較強(qiáng),而磁珠在得率,可重復(fù)性以及自動(dòng)化方面有明顯的優(yōu)勢(shì)。

免疫共沉淀分析(Co-IP)實(shí)驗(yàn)原理與IP十分類似,基本的技術(shù)都是采用目標(biāo)抗原特異性的固相化抗體;但I(xiàn)P的目標(biāo)是純化單一抗原,而Co-IP旨在分離抗原及與抗原結(jié)合的蛋白質(zhì)或配體。

在Co-IP實(shí)驗(yàn)中,已知抗原稱為誘餌蛋白,與之結(jié)合的蛋白則稱為靶蛋白。靶蛋白可能是一些復(fù)雜的伴侶蛋白、信號(hào)分子、結(jié)構(gòu)蛋白、輔助因子等,蛋白間相互作用強(qiáng)度范圍可能介于高度瞬時(shí)和十分穩(wěn)定之間?;镜腃o-IP實(shí)驗(yàn)方案與IP相同,實(shí)際上任何IP系統(tǒng)均可用于Co-IP。但是,還有許多其他因素需要考慮,例如,結(jié)合和洗滌條件的優(yōu)化,優(yōu)化時(shí),需要考慮到誘餌蛋白-靶蛋白的相互作用強(qiáng)度以及抗體-誘餌蛋白的親和力。
免疫沉淀技術(shù)的優(yōu)缺點(diǎn)?

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Co-IP的優(yōu)勢(shì):
1. 生理相關(guān)性:Co-IP可以在接近生理?xiàng)l件的條件下捕獲蛋白質(zhì)相互作用。
2. 特異性:使用特異性抗體可以提高實(shí)驗(yàn)的特異性。
3. 廣泛應(yīng)用:Co-IP技術(shù)適用于多種樣本類型,包括細(xì)胞培養(yǎng)、組織樣本等。
Co-IP的局限性:
1. 抗體依賴性:需要高質(zhì)量的特異性抗體,否則可能得到假陽性或假陰性結(jié)果。
2. 非特異性結(jié)合:可能存在非特異性結(jié)合問題,需要仔細(xì)的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和對(duì)照來控制。
3. 技術(shù)挑戰(zhàn):對(duì)于低豐度或弱相互作用的蛋白質(zhì),Co-IP可能面臨技術(shù)挑戰(zhàn)。
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免疫沉淀樣本的制備。上海蛋白免疫沉淀磁珠哪個(gè)公司好用

“免疫沉淀”一般是指采用固定在固相支持物上的結(jié)合蛋白,進(jìn)行小規(guī)模的蛋白質(zhì)親和純化的實(shí)驗(yàn)。更確切地說,IP是采用固定在微珠支持物(一般是瓊脂糖樹脂)上的特定抗體,從復(fù)雜的混合物中,純化單一抗原的實(shí)驗(yàn)。固定化蛋白質(zhì)復(fù)合物的組裝既可以分步進(jìn)行,也可以一步完成。

常見的加樣順序:抗體和樣本(如細(xì)胞裂解物)一起孵育,然后加入親和微珠,用于捕獲抗體-抗原復(fù)合物。也可以將抗體和微珠(通過抗體結(jié)合蛋白,如蛋白A、G或A/G等,直接或間接結(jié)合抗體)先進(jìn)行孵育,然后再加入含有抗原的樣本。當(dāng)抗原、抗體和固相支持物產(chǎn)生結(jié)合以后,充分洗滌微珠,再采用適當(dāng)?shù)南疵摼彌_液從支持物上洗脫抗原。
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上海世途科生物(CYTOCH)是一家生命科學(xué)上游工具類企業(yè)。聚焦于細(xì)胞生物學(xué)相關(guān)的化學(xué)技術(shù)及相關(guān)產(chǎn)品的開發(fā)與生產(chǎn),產(chǎn)品覆蓋細(xì)胞培養(yǎng)產(chǎn)品如胎牛血清,支原體檢測(cè),支原體去除試劑等,細(xì)胞轉(zhuǎn)染產(chǎn)品如轉(zhuǎn)染試劑,及細(xì)胞檢測(cè)產(chǎn)品如增殖凋亡檢測(cè),報(bào)告基因等多個(gè)科研場(chǎng)景,給終端客戶提供良好的產(chǎn)品以及服務(wù)。

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標(biāo)簽: 免疫沉淀 支原體