南京Co IP免疫沉淀磁珠哪個公司好用

來源: 發(fā)布時間:2024-06-01

RIP實驗步驟通常包括:
1. 細胞收集與交聯(lián):培養(yǎng)細胞至適當密度。使用交聯(lián)劑(如甲醛)進行交聯(lián),以固定蛋白質(zhì)-RNA復合物。
2. 細胞裂解:收集細胞并進行裂解,釋放RNA-蛋白質(zhì)復合物。在裂解過程中添加蛋白酶抑制劑以防止蛋白質(zhì)降解。
3. 超聲處理:使用超聲波破壞細胞,獲得更小的染色質(zhì)片段,這有助于后續(xù)步驟中抗體的接觸。
4. 除去細胞碎片:通過離心去除細胞碎片和未裂解的細胞,收集含RNA-蛋白質(zhì)復合物的上清液。
5. 免疫沉淀:將針對特定RNA結合蛋白(RBP)的抗體加入到上清液中。孵育一段時間,使抗體與目標蛋白充分結合。
6. 捕獲免疫復合物:添加蛋白A或蛋白G結合的磁珠或瓊脂糖珠。孵育使抗體-蛋白質(zhì)-RNA復合物與珠子結合。
7. 洗滌:多次洗滌珠子以去除未特異性結合的蛋白質(zhì)和RNA。
8. 洗脫與逆轉交聯(lián):使用適當?shù)木彌_液洗脫免疫復合物。使用蛋白酶K處理樣品以逆轉交聯(lián),釋放RNA。
9. RNA提取與純化:從免疫沉淀樣品中提取RNA,并進行純化。
10. RNA分析:使用qPCR、Northern blot、RNA-Seq等方法分析沉淀的RNA,以確定與目標蛋白相互作用的RNA種類。
免疫沉淀技術IP的實驗設計。南京Co IP免疫沉淀磁珠哪個公司好用

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免疫沉淀純化所得抗原量低有多種原因,
A. 純化所得抗原量低
1. 抗原結合水平低
IP 應用中出現(xiàn)低抗原結合水平的可能原因有很多,結合反應所使用的溶液是重要原因之一。必須使用適合的緩沖液,有特定的pH和鹽濃度,可能還需要添加互作所需的輔助因子。IP 或Co-IP 中用于純化的抗體是影響得率的另一個重要因素。如果抗體本身易失活或與抗原結合微弱,則可能很難找到足夠溫和的條件,即能產(chǎn)生結合,又能保證在孵育和洗滌過程中結合可以穩(wěn)定保持。
2. 抗原洗脫水平低
在某些情況下,抗原與抗體或結合蛋白結合之間可能會發(fā)生極強的相互作用,傳統(tǒng)的洗脫緩沖液無法將其破壞。如果需要使用溫和洗脫緩沖液收集功能性抗原,則上述矛盾尤為突出。

南京anti Flag免疫沉淀磁珠原理免疫沉淀技術的實驗方法。

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Co-IP(免疫共沉淀)技術主要用于研究蛋白質(zhì)之間的相互作用,其應用場景如下:
1. 蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡的鑒定:Co-IP可用于構建蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡,發(fā)現(xiàn)目標蛋白的結合伙伴。
2. 信號傳導途徑的研究:通過Co-IP技術,科學家們發(fā)現(xiàn)了許多關鍵的細胞信號通路,如MAPK和PI3K/Akt通路等,為深入理解這些通路的功能和調(diào)控機制提供了重要線索。
3. 藥物靶點篩選:利用Co-IP技術,研究人員可以篩選潛在的藥物靶點。
疾病機制研究:通過分析疾病相關蛋白質(zhì)的相互作用,Co-IP有助于揭示疾病的分子機制。
4. 抗體藥物開發(fā):Co-IP可用于研究抗體藥物與其靶標蛋白的結合特性,評估抗體藥物的親和力和特異性。
5. 轉錄因子研究:Co-IP技術可以用于研究轉錄因子與蛋白質(zhì)的相互作用,進而揭示基因調(diào)控網(wǎng)絡。

染色質(zhì)免疫共沉淀(Chromatinimmunoprecipitation,ChIP)技術是目前公認的研究此相互作用的選擇,是真核生物基因表達機制研究中不可或缺的技術之一。
它的基本原理是在活細胞狀態(tài)下,固定蛋白質(zhì)-DNA(染色質(zhì))復合物,并將其切斷為一定長度范圍內(nèi)的染色質(zhì)小片段,然后通過免疫學方法(抗體親和)沉淀此復合體,特異性地富集目的蛋白結合的 DNA,通過對目的片段的純化與后期檢測,從而獲得蛋白質(zhì)與 DNA 相互作用的信息。
這項技術通過蛋白質(zhì)與DNA互作來分析目標基因活性以及已知蛋白質(zhì)的靶基因,被廣泛應用于體內(nèi)轉錄調(diào)控因子與靶基因啟動子上特異核苷酸序列結合方面的研究。該技術常與DNA芯片和分子克隆技術相結合。
免疫沉淀技術IP是什么?

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免疫沉淀實驗步驟:
1. 樣品制備
a. 懸浮細胞樣品處理:離心收集細胞(4℃, 1000g, 5 min),用手指把細胞用力彈散。按照6孔板每孔細胞加入150-250 μL裂解液的比例加入含蛋白酶抑制劑的裂解液(裂解液應在使用前數(shù)分鐘內(nèi)加入蛋白酶抑制劑Cocktail,使蛋白酶抑制劑Cocktail的終濃度為1×)?;靹蚝笾糜诒咸幚?0 min;離心收集上清液(4℃, 14000g, 10 min),置于冰上備用(或置于-20℃長期保存)。
b. 貼壁細胞樣品處理:移去培養(yǎng)基,用PBS清洗細胞兩遍;用細胞刮棒刮脫細胞,收集至1.5mL EP管內(nèi),按照6孔板每孔加入150-250 μL裂解液的比例加入含蛋白酶抑制劑的裂解液(裂解液應在使用前數(shù)分鐘內(nèi)加入蛋白酶抑制劑Cocktail,使蛋白酶抑制劑Cocktail的終濃度為1×)。吹打數(shù)下,使裂解液和細胞充分接觸?;靹蚝笾糜诒咸幚?0 min;離心收集上清液(4℃, 14000g, 10 min),置于冰上備用(或置于-20℃長期保存)。
4. 后續(xù):磁珠預處理——抗體吸附——抗原結合反應——抗體洗脫
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免疫沉淀Co-IP抗體的選擇?南京Co IP免疫沉淀磁珠哪個公司好用

RNA免疫沉淀技術(RIP)是一種研究RNA與蛋白質(zhì)相互作用的重要方法,其應用領域主要包括:
1. 轉錄后調(diào)控研究:RIP技術可以幫助研究者了解RNA在轉錄后水平如何被調(diào)控。
2. 表觀遺傳調(diào)控:RIP技術用于研究RNA結合蛋白(RBPs)在表觀遺傳調(diào)控中的作用。
3. 非編碼RNA功能研究:RIP技術可以用來研究長非編碼RNA(lncRNA)、miRNA和其他小RNA的種類,以及它們?nèi)绾闻c蛋白質(zhì)相互作用來調(diào)控基因表達。
4. RNA病毒研究:RIP技術也可用于研究RNA病毒與其宿主細胞內(nèi)蛋白質(zhì)的相互作用,進而了解病毒復制和致病機制。
5. RNA修飾和甲基化研究:RIP技術結合其他技術如m5C-RIP-seq,可用于研究RNA甲基化修飾及其在病理過程中的作用。
6. RNA定位和穩(wěn)定性:通過RIP技術,研究者可以探索特定RNA在細胞內(nèi)的定位以及它們?nèi)绾伪环€(wěn)定或降解。
7. RNA-蛋白質(zhì)復合物的鑒定:RIP技術可以用來鑒定與特定RNA結合的蛋白質(zhì),從而揭示RNA-蛋白質(zhì)復合物的組成。
8. 疾病相關RNA研究:RIP技術在疾病相關RNA的研究中也有應用。
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