杭州國產(chǎn)數(shù)字PCR原理

來源: 發(fā)布時間:2022-05-12

與常規(guī)的PCR的方法相比,dPCR有很好的優(yōu)勢。


***定量

常規(guī)PCR和實時熒光PCR定量檢測都需要已知拷貝數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)DNA制定標(biāo)準(zhǔn)曲線,由于樣品測定在各種條件上不會完全一致,會造成PCR擴(kuò)增效率的差異,從而影響定量結(jié)果的準(zhǔn)確性。而ddPCR不受標(biāo)準(zhǔn)曲線和擴(kuò)增動力學(xué)影響,可以進(jìn)行***定量。


樣品需求量低

在檢測珍貴樣品和樣品核酸存在降解時具有明顯的優(yōu)勢。


高靈敏度

ddPCR本質(zhì)上是將一個傳統(tǒng)的PCR反應(yīng)分成了數(shù)萬個**的PCR反應(yīng),在這些反應(yīng)中可以精確地檢測到很小的目的片段的差異、單拷貝甚至是低濃度混雜樣品,且能避免非同源異質(zhì)雙鏈的形成。


高耐受性

由于目的序列被分配到多個微滴中,***降低了體系間的影響以及背景序列和***物對反應(yīng)的干擾,擴(kuò)增基質(zhì)效應(yīng)大大減小。 分辨率——低至0.1倍基因表達(dá)差異。杭州國產(chǎn)數(shù)字PCR原理

杭州國產(chǎn)數(shù)字PCR原理,數(shù)字PCR

       目前數(shù)字PCR技術(shù)在臨床領(lǐng)域已經(jīng)有著非常***且***地應(yīng)用,例如在病原微生物檢測中的應(yīng)用:HBV檢測、HIV檢測、甲型流感病毒檢測等;在產(chǎn)前診斷中的應(yīng)用:13/18/21號染色體三倍體檢測、遺傳性耳聾檢測、地中海貧血檢測及優(yōu)生五項的病毒檢測等;在**靶向***相關(guān)基因檢測中的應(yīng)用:肺*EGFR基因突變、ALK基因融合檢測、結(jié)直腸*KRAS、BRAF基因突變檢測、乳腺*HER2基因擴(kuò)增檢測、神經(jīng)膠質(zhì)瘤IDH基因突變檢測等。以**靶向***相關(guān)基因檢測為例,在**形成的超早期,會出現(xiàn)**細(xì)胞的壞死和凋亡,這些凋亡或壞死的**細(xì)胞會釋放其DNA進(jìn)入外周血,因此通過分析循環(huán)血液中是否含有**特異的游離DNA就可以達(dá)到**早期篩查的目的。然而此時DNA含量極低,對檢測的靈敏度和精確性要求極高,目前只有數(shù)字PCR技術(shù)可以檢測出來。另外進(jìn)行個體化***時,需要對基因組樣本進(jìn)行分析,此時利用數(shù)字PCR技術(shù)也能**提高結(jié)果的可信性,進(jìn)而建立合理***方案。南京廣州永諾數(shù)字PCR品牌不依賴Ct值,無需標(biāo)準(zhǔn)曲線。

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二代測序輔助建庫

       目前靶向測序建庫方法包括擴(kuò)增子方法,在均相溶液中,當(dāng)擴(kuò)增引物增加時,由于擴(kuò)增引物之間的相互作用,從而影響擴(kuò)增的效率;如果將其分散到大量微液滴中擴(kuò)增,將可降低引物間相互作用,提高擴(kuò)增效率。同時還可以實現(xiàn)對于少量模板的有效擴(kuò)增,得到更多的有效測序數(shù)據(jù)。


CRISPR-Cas9基因編輯結(jié)果驗證

       CRISPR-Cas9技術(shù)的發(fā)明,是基因編輯技術(shù)的一大突破,但如何驗證實驗是否成功,仍需要高靈敏度的檢測方法,數(shù)字PCR技術(shù)可以滿足這一需求。Broad研究所張鋒團(tuán)隊發(fā)明了以CRISPR為基礎(chǔ)的SHERLOCK技術(shù)可以對核酸進(jìn)行高靈敏度的定性檢測,但精確定量評估時仍采取了數(shù)字PCR進(jìn)行確認(rèn)。

MicroDrop-100系統(tǒng)產(chǎn)品特點(diǎn):

一、適應(yīng)性廣,靈活性高

1、理論上可覆蓋qPCR(熒光定量PCR)的所有應(yīng)用

2、樣本多樣性,樣本通量可達(dá)96個樣本,支持靈活設(shè)定

3、開放式平臺,支持用戶自行開發(fā)試劑、產(chǎn)品。


二、靈敏度高,準(zhǔn)確性高

1、***定量——無需依賴標(biāo)準(zhǔn)曲線

2、采用微滴式技術(shù)高達(dá)100,000個的微滴

3、線性范圍達(dá)到6個數(shù)量級,靈敏度高達(dá)萬分之一


三、可分析復(fù)雜混合物

1、準(zhǔn)確度不完全依賴于擴(kuò)增效率

2、雙通道熒光檢測,支持EvaGreen染料及探針法

3、支持多重數(shù)字PCR


四、操作簡單,使用方便

1、全封閉防污染設(shè)計,一鍵式自動化操作。

2、可選全中文分析軟件 樣本多樣性,樣本通量可達(dá)96個樣本,支持靈活設(shè)定。

杭州國產(chǎn)數(shù)字PCR原理,數(shù)字PCR

       數(shù)字PCR是一種核酸分子***定量技術(shù)。當(dāng)前核酸分子的定量有三種方法,光度法基于核酸分子的吸光度來定量;,Ct值就是指可以檢測到熒光值對應(yīng)的循環(huán)數(shù);數(shù)字PCR是***的定量技術(shù),基于單分子PCR方法來進(jìn)行計數(shù)的核酸定量,是一種***定量的方法。主要采用當(dāng)前分析化學(xué)熱門研究領(lǐng)域的微流控或微滴化方法,將大量稀釋后的核酸溶液分散至芯片的微反應(yīng)器或微滴中,每個反應(yīng)器的核酸模板數(shù)少于或者等于1個。這樣經(jīng)過PCR循環(huán)之后,有一個核酸分子模板的反應(yīng)器就會給出熒光信號,沒有模板的反應(yīng)器就沒有熒光信號。根據(jù)相對比例和反應(yīng)器的體積,就可以推算出原始溶液的核酸濃度。永諾生物MicroDrop-100微滴式數(shù)字PCR儀超越行業(yè)的10萬個微滴數(shù),保證泊松分布所需要的充分的樣本量。JUE對定量數(shù)字PCR正規(guī)代理

率先行業(yè)的10萬個微滴數(shù),保證泊松分布所需要的充分的樣本量。杭州國產(chǎn)數(shù)字PCR原理

       微滴式數(shù)字PCR系統(tǒng)在傳統(tǒng)的PCR擴(kuò)增前對樣品進(jìn)行微滴化處理,即將含有核酸分子的反應(yīng)體系分成成千上萬個納升級的微滴,其中每個微滴或不含待檢核酸靶分子,或者含有一個至數(shù)個待檢核酸靶分子。經(jīng)PCR擴(kuò)增后,逐個對每個微滴進(jìn)行檢測,有熒光信號的微滴判讀為1,沒有熒光信號的微滴判讀為0,根據(jù)泊松分布原理及陽性微滴的個數(shù)與比例即可得出靶分子的起始拷貝數(shù)或濃度。


與傳統(tǒng)PCR相比所具有的優(yōu)勢

       不依賴Ct值或內(nèi)參基因,即可確定低至單拷貝的待檢靶分子的***數(shù)目。微滴技術(shù)讓數(shù)字PCR更低成本,且更實用。





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