廣州微流控芯片數(shù)字PCR如何選型

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-02-10

        精細(xì)診斷是精細(xì)醫(yī)學(xué)的關(guān)鍵環(huán)節(jié),液體活檢作為一種無創(chuàng)、均一的檢測(cè)技術(shù),迅速成為精細(xì)診斷領(lǐng)域的新星,2015年被《麻省理工大學(xué)科技評(píng)論》評(píng)選為年度**突破技術(shù), 2017年入選世界經(jīng)濟(jì)論壇評(píng)出的全球**新興技術(shù),引發(fā)了全球科研、臨床和產(chǎn)業(yè)界的極大熱情,已在**、產(chǎn)前診斷、***移植等疾病領(lǐng)域***被應(yīng)用。

       數(shù)字PCR技術(shù)與高通量的二代測(cè)序技術(shù),共同組成液體活檢領(lǐng)域的兩大利器;數(shù)字PCR技術(shù)是公認(rèn)的液體活檢領(lǐng)域靈敏度比較高的檢測(cè)方法,采用有限稀釋的方法將目標(biāo)分子分割到**的反應(yīng)體系中,在不依賴標(biāo)準(zhǔn)曲線條件下實(shí)現(xiàn)靶標(biāo)***定量檢測(cè),能檢測(cè)低至0.01%的突變基因;Bio-Rad及Thermo Fisher目前是這一領(lǐng)域的主導(dǎo)者,分別采用微滴或芯片方式將樣本分割成兩萬份,MiniDrop?創(chuàng)新性采用高壓驅(qū)動(dòng)的方法將樣本分割成50萬份,打破了國外廠商在微滴式數(shù)字PCR領(lǐng)域的壟斷。



MicroDrop?數(shù)字PCR平臺(tái)是由永諾生物自主研發(fā)并已投入生產(chǎn)的微滴式數(shù)字PCR檢測(cè)系統(tǒng)。廣州微流控芯片數(shù)字PCR如何選型

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       在定量PCR時(shí),我們常常糾結(jié)一個(gè)問題,究竟是相對(duì)定量還是***定量呢?如今,你無需糾結(jié)了,因?yàn)閿?shù)字PCR(digital PCR)來了。盡管這兩種技術(shù)有些類似,都是估計(jì)起始樣品中的核酸量,但它們有一個(gè)重要的區(qū)別。定量PCR是依靠標(biāo)準(zhǔn)曲線或參照基因來測(cè)定核酸量,而數(shù)字PCR則讓你能夠直接數(shù)出DNA分子的個(gè)數(shù),是對(duì)起始樣品的***定量。因此特別適用于依靠Ct值不能很好分辨的應(yīng)用領(lǐng)域:拷貝數(shù)變異、突變檢測(cè)、基因相對(duì)表達(dá)研究(如等位基因不平衡表達(dá))、二代測(cè)序結(jié)果驗(yàn)證、miRNA表達(dá)分析、單細(xì)胞基因表達(dá)分析等。廣州微流控芯片數(shù)字PCR如何選型線性范圍達(dá)到6個(gè)數(shù)量級(jí),靈敏度低至萬分之一。

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       微滴式數(shù)字PCR系統(tǒng)在傳統(tǒng)的PCR擴(kuò)增前對(duì)樣品進(jìn)行微滴化處理,即將含有核酸分子的反應(yīng)體系分成成千上萬個(gè)納升級(jí)的微滴,其中每個(gè)微滴或不含待檢核酸靶分子,或者含有一個(gè)至數(shù)個(gè)待檢核酸靶分子。經(jīng)PCR擴(kuò)增后,逐個(gè)對(duì)每個(gè)微滴進(jìn)行檢測(cè),有熒光信號(hào)的微滴判讀為1,沒有熒光信號(hào)的微滴判讀為0,根據(jù)泊松分布原理及陽性微滴的個(gè)數(shù)與比例即可得出靶分子的起始拷貝數(shù)或濃度。


與傳統(tǒng)PCR相比所具有的優(yōu)勢(shì)

       不依賴Ct值或內(nèi)參基因,即可確定低至單拷貝的待檢靶分子的***數(shù)目。微滴技術(shù)讓數(shù)字PCR更低成本,且更實(shí)用。





       MicroDrop-100微滴式數(shù)字PCR是具有國內(nèi)自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的第三代JUE對(duì)定量PCR系統(tǒng),整套系統(tǒng)由MicroDrop-100A微滴生成儀、 MicroDrop-100B微滴檢測(cè)儀以及結(jié)果數(shù)據(jù)分析設(shè)備等構(gòu)成。系統(tǒng)通過自主設(shè)計(jì)的微流控芯片,利用油水相不兼容的原理,在2分鐘時(shí)間內(nèi)將PCR體系分割成100,000油包水的體系,每個(gè)體系為**的PCR反應(yīng)體系,體積約為0.2nL,單次實(shí)驗(yàn)一次可生成8個(gè)樣本的油包水體系。由于油包水體系的分割效應(yīng),使得數(shù)字PCR受PCRYi制物的影響相對(duì)較小,有利于復(fù)雜環(huán)境樣本的實(shí)驗(yàn)操作。區(qū)別于熒光定量PCR的過程性判讀方法,數(shù)字PCR結(jié)果判讀為終點(diǎn)法,故其對(duì)PCR擴(kuò)增效率的依賴也相對(duì)較小。  采用主流可靠的解決方案,由微滴生成儀、微滴檢測(cè)儀、數(shù)據(jù)分析軟件組成。

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二代測(cè)序輔助建庫

       目前靶向測(cè)序建庫方法包括擴(kuò)增子方法,在均相溶液中,當(dāng)擴(kuò)增引物增加時(shí),由于擴(kuò)增引物之間的相互作用,從而影響擴(kuò)增的效率;如果將其分散到大量微液滴中擴(kuò)增,將可降低引物間相互作用,提高擴(kuò)增效率。同時(shí)還可以實(shí)現(xiàn)對(duì)于少量模板的有效擴(kuò)增,得到更多的有效測(cè)序數(shù)據(jù)。


CRISPR-Cas9基因編輯結(jié)果驗(yàn)證

       CRISPR-Cas9技術(shù)的發(fā)明,是基因編輯技術(shù)的一大突破,但如何驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)是否成功,仍需要高靈敏度的檢測(cè)方法,數(shù)字PCR技術(shù)可以滿足這一需求。Broad研究所張鋒團(tuán)隊(duì)發(fā)明了以CRISPR為基礎(chǔ)的SHERLOCK技術(shù)可以對(duì)核酸進(jìn)行高靈敏度的定性檢測(cè),但精確定量評(píng)估時(shí)仍采取了數(shù)字PCR進(jìn)行確認(rèn)。 MiniDrop?研發(fā)團(tuán)隊(duì)由微流控、光學(xué)、機(jī)電學(xué)、化學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)、分子生物學(xué)等多學(xué)科交叉領(lǐng)域的**組成。南通廣東數(shù)字PCR正規(guī)代理

全封閉防污染設(shè)計(jì),一鍵式自動(dòng)化操作。廣州微流控芯片數(shù)字PCR如何選型

無創(chuàng)產(chǎn)前檢查

       鐮狀細(xì)胞貧血(sickle cell anemia)是HBB基因突變引起的常染色體顯性遺傳病,有嚴(yán)重的危害,可以導(dǎo)致高達(dá)5%的胎兒死亡率及4.62%的孕婦死亡率。而精細(xì)有效的無創(chuàng)產(chǎn)前診斷是預(yù)防鐮狀細(xì)胞貧血患兒出生的有效方法。研究人員采用dPCR技術(shù)檢測(cè)孕婦胎兒游離DNA(cff-DNA)HBB基因突變。結(jié)果顯示,dPCR技術(shù)能夠確定87%的男性胎兒(n=45)和75%的女性胎兒(n=20)HBB基因的突變狀態(tài)。當(dāng)cff-DNA濃度大于7%時(shí),可以**的檢測(cè)出HBB基因突變[3],可以說是相當(dāng)厲害了。


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浚和(上海)儀器有限公司是一家供應(yīng)國內(nèi)外先進(jìn)儀器和設(shè)備的專業(yè)供應(yīng)商和服務(wù)商,致力于為客戶提供專業(yè)的定制化解決方案。多年來,持續(xù)為醫(yī)藥、化工、高校、科研單位、檢測(cè)院等多個(gè)行業(yè)提供先進(jìn)的產(chǎn)品和專業(yè)的服務(wù)。

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