微生物發(fā)酵是一個復(fù)雜的過程，若想達(dá)到預(yù)期目標(biāo)，就需要選擇適宜的發(fā)酵方式。根據(jù)不同的標(biāo)準(zhǔn)，人們通常對微生物發(fā)酵的類型進(jìn)行如下劃分：根據(jù)在發(fā)酵過程中微生物對O2的需求不同，分為好氧發(fā)酵和厭氧發(fā)酵；根據(jù)培養(yǎng)基的物理性質(zhì)不同，分為固體發(fā)酵、半固體發(fā)酵和液體發(fā)酵；根據(jù)發(fā)酵過程在培養(yǎng)基的發(fā)生位置不同，分為表面發(fā)酵和深層發(fā)酵；根據(jù)發(fā)酵工藝流程是否連續(xù)進(jìn)行，分為分批發(fā)酵和連續(xù)發(fā)酵；根據(jù)菌種是否被固定在載體上，分為游離發(fā)酵和固定化發(fā)酵；根據(jù)菌種是否單一，分為單一純種發(fā)酵和混合發(fā)酵。氨基酸等初級代謝產(chǎn)物的產(chǎn)率與菌體濃度成正比。陜西發(fā)酵液
生物發(fā)酵飼料的相關(guān)應(yīng)用十分多，根據(jù)發(fā)酵產(chǎn)物分類，可分為微生物酶發(fā)酵、微生物菌體發(fā)酵、微生物代謝產(chǎn)物發(fā)酵、微生物的轉(zhuǎn)化發(fā)酵、生物工程細(xì)胞發(fā)酵等。根據(jù)使用微生物的種類分類，可分為好氧發(fā)酵和厭氧發(fā)酵兩種類型。根據(jù)使用不同狀態(tài)的培養(yǎng)基分類，可分為固體發(fā)酵飼料和液體發(fā)酵飼料兩種類型。目前固態(tài)厭氧發(fā)酵的工藝在我國更為成熟，且厭氧發(fā)酵相較好氧發(fā)酵具有能耗低、能長期存放、不易變質(zhì)等優(yōu)勢。主要用于生物飼料發(fā)酵的益生菌微生物種類有乳酸菌、芽孢桿菌、酵母菌和霉菌。目前我國生物飼料中發(fā)酵豆粕、釀酒酵母培養(yǎng)物和構(gòu)樹葉等發(fā)酵產(chǎn)品逐漸增多，形成規(guī)模，在飼料企業(yè)和養(yǎng)殖場得到廣泛應(yīng)用。新疆進(jìn)口發(fā)酵技術(shù)發(fā)酵過程中所遇到的泡沫，其分散相是無菌空氣和代謝氣體，連續(xù)相是發(fā)酵液。
在發(fā)酵過程中，微生物只能利用溶解狀態(tài)下的氧(有報道說處在氣—液界面處的微生物也能直接利用氣相中的氧)。氧是很難溶解的氣體，在25℃、100MPa下，空氣在水中的溶解氧為0.25mmol/L，相同條件下在發(fā)酵液中的溶解氧為0.2mmol/L，在谷氨酸發(fā)酵的操作灸件下，發(fā)酵液中氧的飽和濃度約為0.313mmol/L。在這種溶氧濃度下菌的正常呼吸只能維持20~30s。由于微生物不斷消耗發(fā)酵液中的氧，而氧的溶解度又很低，故必須采取強化供氧。在發(fā)酵工業(yè)中，隨著高產(chǎn)菌株的篩得，高濃度發(fā)酵、豐富培養(yǎng)基的采用對通氣和攪拌的要求更高。在豐富培養(yǎng)基內(nèi)，發(fā)酵旺盛期間，即使培養(yǎng)液完全被空氣飽和，它所貯存的氧也是很少的，只能維持菌正常呼吸15~30s，之后菌的呼吸就受到抑制。這種隨時都有室息可能的狀態(tài)，是由于微生物在人工環(huán)境內(nèi)比較集中，濃度大；另外在這種稠厚的培養(yǎng)液中氧的溶解度比在水中更小。這就決定了大多數(shù)的好氣性發(fā)酵需要有適當(dāng)?shù)耐鈼l件才能維持一定的生產(chǎn)水平。
發(fā)酵原理的主要內(nèi)容是微生物復(fù)雜系統(tǒng)運行的自然規(guī)律（即微生物生命活動的三個基本假說）。代謝能支撐假說（生命活動的前提，動力）暗示：微生物活細(xì)胞是耗散結(jié)構(gòu)，這種結(jié)構(gòu)依靠代謝能來支撐。這個假說體現(xiàn)了生命活動的空間性（方位排列的有序）、時間性（周期變化的有序）。代謝網(wǎng)絡(luò)假說（生命活動的內(nèi)容，結(jié)構(gòu)）顯示：代謝網(wǎng)絡(luò)是細(xì)胞代謝活動的運行圖。這個假說體現(xiàn)了生命活動的整體性、流動性、層次性。細(xì)胞經(jīng)濟(jì)假說（生命活動的法則，控制）揭示細(xì)胞經(jīng)濟(jì)的運行原理，它們體現(xiàn)了細(xì)胞代謝活動的自主性。菌種分離：根據(jù)生產(chǎn)要求和菌種特征性采用各種不同的篩選方法從眾多的雜菌種分離出所需的性能良好的純種。
生物發(fā)酵工程是生物工程的一個重要組成部分，微生物利用碳水化合物發(fā)酵生產(chǎn)各種工業(yè)溶劑和化工原料。乙醇、丁醇-異丙醇、2,3-丁二醇和甘油發(fā)酵是微生物進(jìn)行溶劑發(fā)酵的幾種形式。發(fā)酵一般泛指利用微生物制造工業(yè)原料或產(chǎn)品的過程。由微生物（細(xì)菌、酵母等）、有機物（主要是碳水化合物）、培養(yǎng)基等在一定的溫度和pH等條件下進(jìn)行。發(fā)酵技術(shù)指的是人們利用微生物的發(fā)酵作用，運用一些技術(shù)手段控制發(fā)酵的過程，從而進(jìn)行大規(guī)模生產(chǎn)發(fā)酵產(chǎn)品的技術(shù)。發(fā)酵的概念來源于釀酒的過程，而發(fā)酵初來源于拉丁語的“發(fā)泡”。早在幾千年前，我們祖先就已經(jīng)開始使用發(fā)酵技術(shù)進(jìn)行釀酒、調(diào)味品的調(diào)制，積累了豐富的發(fā)酵經(jīng)驗。初，發(fā)酵技術(shù)主要用于一些家庭作坊進(jìn)行手工制作產(chǎn)品，產(chǎn)品的質(zhì)量和數(shù)量都不盡如人意，后來，隨著社會的不斷發(fā)展和工業(yè)化的不斷深入，實現(xiàn)了工業(yè)化的規(guī)模生產(chǎn)。發(fā)酵技術(shù)主要是通過使用微生物進(jìn)行發(fā)酵，制作出獨特風(fēng)味的食品，包括酸奶、酒類以及調(diào)味品、腐乳臘腸、而在不同種類的食品發(fā)酵中，其原理和應(yīng)用也是不盡相同。 使空氣通過經(jīng)高溫滅菌的介質(zhì)過濾層，將空氣中的微生物等顆粒阻截在介質(zhì)層中，從而達(dá)到除菌的目的。浙江綠色發(fā)酵
微生物發(fā)酵過程根據(jù)發(fā)酵條件要求分為好氧發(fā)酵和厭氧發(fā)酵。陜西發(fā)酵液
發(fā)酵時微生物分泌的酶能裂解細(xì)胞壁，能提高營養(yǎng)素的利用程度。肉和奶等動物性食品，在發(fā)酵過程中可將原有的蛋白質(zhì)進(jìn)行分解，易于消化吸收。微生物還能合成一些B族維生素，特別是維生素B12，動物和植物自身都無法合成這一維生素，只有微生物能“生產(chǎn)”。發(fā)酵食品一般脂肪含量較低，因為發(fā)酵過程中要消耗碳水化合物的能量，是減輕體重人士的優(yōu)先健康食品。
我們現(xiàn)在常吃的發(fā)酵食品主要分為谷物發(fā)酵制品、豆類發(fā)酵品和乳類發(fā)酵品。
不要一味將發(fā)酵食物當(dāng)做對健康的“洪水猛獸”，合理食用和選擇，對健康也是大有益處。 陜西發(fā)酵液
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