循環(huán)水系統(tǒng)處理的對象一般是含有大量固體懸浮物或溶解性的物質(zhì)，這些物質(zhì)排入到養(yǎng)殖水中后會在細菌的作用下，分解成氨、硫化氫等對水生動物有毒的物質(zhì)。因此，一時間將這些污染物截留并盡可能地將這些污染物變廢為寶，是循環(huán)水處理系統(tǒng)的功能所在。循環(huán)水處理系統(tǒng)首先包括機械過濾部分。這些設備會將水中的固體懸浮物在一時間過濾出來。經(jīng)常用到的設備是蛋白質(zhì)分離器、微濾機、精密過濾器等設備。其次，循環(huán)水處理系統(tǒng)還有生化過濾設備。這些設備是為了培養(yǎng)相應的微生物來對水中溶解性物質(zhì)進行分解分離的。
循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)難點是解決氮循環(huán)的問題，要消除氨氮和亞硝/酸氮的影響。傳統(tǒng)的解決方案是在循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)中加入了反硝化反應池，但由于反硝化作用需要在嚴格厭氧條件下進行，因此硝化作用反應池需要跟反硝化作用反應池分開，這就增加了循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)的成本。前循環(huán)水養(yǎng)殖設備已實現(xiàn)工廠化生產(chǎn)，實現(xiàn)養(yǎng)殖池與養(yǎng)殖凈化設備的無縫連接。通過一系列的物理過濾、化學沉淀以及通過微生物的作用去除氨氮、硝氮和亞硝氮再通過殺菌消毒、充氧等操作，水體重新流回到循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)中，實現(xiàn)養(yǎng)殖水的循環(huán)利用。
氣壓的降低，造成水體對氧的溶解度降低，導致水體缺氧。在氣壓低的情況下，常可見水體底部污染物泛起，這就是所謂“泛塘現(xiàn)象?！胺禾痢钡慕Y(jié)果造成水底因缺氧而抑制的好氧菌重新得到獲取氧氣的機會，由此急劇消耗水體溶氧。工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖模式仍然是未來具有發(fā)展?jié)摿Φ年懟h(huán)水養(yǎng)殖模式, 是中國開創(chuàng)現(xiàn)代水產(chǎn)業(yè)的重要組成部分。隨著核心裝備的國產(chǎn)化、水處理工藝的成熟化、養(yǎng)殖管理的科學化, 集“裝備工程化、技術(shù)現(xiàn)代化、生產(chǎn)工廠化、管理工業(yè)化”為一體的現(xiàn)代工業(yè)化養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)新模式將會被建立, 水產(chǎn)業(yè)的轉(zhuǎn)型升級, 海淡水養(yǎng)魚大產(chǎn)業(yè)的架構(gòu), 才能夠?qū)崿F(xiàn), 而中國水產(chǎn)業(yè)將進入工業(yè)化養(yǎng)殖新時代, 屆時, 中國不僅是世界水產(chǎn)大國, 也同樣會是世界水產(chǎn)強國。