重金屬廢水的治理，必須采用綜合措施。首先，從根本上是改革生產工藝，不用或少用毒性大的重金屬；其次是在使用重金屬的生產過程中采用合理的工藝流程和完善的生產設備，實行科學的生產管理和運行操作，減少重金屬的耗用量和隨廢水的流失量；在此基礎上對數量少、濃度低的廢水進行有效的處理。重金屬廢水應當在產生地點就地處理，不同其他廢水混合，以免使處理復雜化。更不應當不經處理直接排入城市下水道，同城市污水混合進入污水處理廠。如果用含有重金屬的污泥和廢水作為肥料和灌溉農田，會使土壤受污染，造成重金屬在農作物中積蓄。在農作物中富集系數較高的重金屬是鎘、鎳和鋅，而在水生生物中富集系數較高的重金屬是汞、鋅等。
醫(yī)院污水處理主要是消毒，即殺滅病原體。常用的方法是氯化消毒或用臭氧消毒（見水的消毒、廢水氧化處理法）。醫(yī)院排出的放射性廢水常用貯存衰減法處理。醫(yī)院常用的放射性同位素如131碘,32磷,198金，24鈉等是半衰期較短的同位素，因此可以將放射性污水貯存于地下專用衰變水池內，貯存時間為10倍于半衰期，把放射性濃度降到容許排放的程度。如果放射性污水的濃度很低，水量很小，也可用稀釋法處理。中國的《放射性防護規(guī)定》要求每一微居里放射性同位素達到容許排放濃度需稀釋水量1.67米3。當放射性污水濃度很高，放射性的半衰期很長，不宜用貯存法和稀釋法處理時，可用蒸發(fā)法、離子交換法或凝聚沉淀法進行分離濃縮處理（見放射性廢水處理）。
重金屬廢水處理 是指為使污水中所含的重金屬達到排水某一水體或再次使用的水質要求，對其進行凈化的過程。重金屬廢水處理的方法大致可以分為三大類：化學法；物理處理法；生物處理法。重金屬廢水處理是指將重金屬廢水中的重金屬去除并予以回收利用或無害化處理的過程。在礦冶、機械制造、化工、電子、儀表等工業(yè)中的許多生產過程中都產生重金屬廢水。例如，金屬表面加工，特別是電鍍過程中排出含有鉻、鎘、銅、鋅、鎳等重金屬和氰*物的漂洗廢水和鍍槽廢液，在使用汞的生產過程中，如使用汞陰極電解法的氯堿制造工業(yè)，使用氯*汞或硫酸汞作催化劑的乙烯生產過程，使用汞作原料的電子和儀器儀表工業(yè)等。