工廠化循環(huán)水從水處理的側(cè)重點不同分為機械模式和生化模式，主要區(qū)別就是看能耗大小，本文所講的是生化模式。這個模式能否成功，與虹吸能否順利運行有直接關(guān)系，虹吸設(shè)備需要時常維護(hù)否則會莫名其妙的失效。有人說：我都準(zhǔn)備投入了30萬，你告我天天還得維護(hù)，這是搞毛線啊？虹吸失敗的話，整個系統(tǒng)視養(yǎng)殖密度在兩天到四天以內(nèi)崩潰----魚蝦死光光。工廠化循環(huán)水系統(tǒng)的重點是凈水系統(tǒng)，占比50%；生物習(xí)性占30%；其他的溶氧恒溫等條件的占比20%。
生化模式凈水主要是靠硝化細(xì)菌，硝化細(xì)菌從無到有這個過程俗稱掛膜。硝化細(xì)菌掛膜需要濾材（細(xì)菌屋）；硝化細(xì)菌屬于好氧細(xì)菌，因此需要氧氣；硝化細(xì)菌繁殖還需要養(yǎng)分，也就是魚糞。再滿足上訴三個情況下，保持25度水溫，硝化細(xì)菌從無到有需要將近35天，15度水溫情況下需要50天或者更久，這個過程叫冷啟動。想快速啟動，可以使用液體硝化細(xì)菌，或者添加一些其他已經(jīng)掛膜的濾材進(jìn)來進(jìn)行引菌，這個過程叫熱啟動。海水系統(tǒng)應(yīng)為高鹽度的問題，自然掛膜時間比淡水系統(tǒng)要長一倍以上，時間也隨鹽度升高而延長。
在水產(chǎn)養(yǎng)殖中，底改顧名思義應(yīng)該就是改良池塘底部理化條件的意思，讓池塘底部的理化條件能夠在適合養(yǎng)殖對象的生存，而這些良好池塘底部理化條件又決定了池塘底部的微生態(tài)圈，從而又決定了池塘有相對高溶解氧、有氧的代謝氨氮和亞*酸鹽等氮循化，起到維護(hù)水體生物穩(wěn)定性的營養(yǎng)庫作用。底改就是為了池塘底部保持合適的（不太多也不太少）有機物含量，以發(fā)揮池塘營養(yǎng)庫作用提高池塘生產(chǎn)力同時耗氧量不會太高。也就是說：避免底泥太瘦水體藻生長不穩(wěn)定，同時避免底泥太肥耗氧量太高而水質(zhì)惡化。很多水產(chǎn)養(yǎng)殖戶對于改底也沒有太多的辦法，主要是通過撒生石灰對底部消毒這種傳統(tǒng)辦法改底，這樣是遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠的。