在分解細菌的作用下，再進一步轉(zhuǎn)化成了氨。被魚類吃掉的一部分經(jīng)過魚類的消化，也轉(zhuǎn)變成氨。殊途同歸的氨在分子態(tài)時是一種劇毒物質(zhì)。在硝化細菌的作用下，它會被轉(zhuǎn)化成亞鹽。亞鹽是一種不太穩(wěn)定的物質(zhì)。在高氧化還原電位的情況下，會被氧化成亞鹽。此時如果有反硝化細菌，鹽就會被轉(zhuǎn)化成N2從水中溢出。這樣，水體中的氮元素就完成了一個完整的轉(zhuǎn)化分離過程。 在實踐中，生物過濾的細菌需要適宜的條件才能起到相應(yīng)的作用。如水體的溫度、PH、溶氧量、合適的碳氧化、殺菌劑等。因此，不僅要求其他系統(tǒng)設(shè)備與生物過濾器配套，更對操作者有一定的技術(shù)要求。
循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)一種新型的養(yǎng)殖模式，也叫工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)、室內(nèi)循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)。是一種通過水處理設(shè)備將養(yǎng)殖水凈化處理后再循環(huán)利用的一種養(yǎng)殖模式。工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)融入了生物學(xué)、工程學(xué)、流體力學(xué)、環(huán)境工程學(xué)、信息學(xué)等多種學(xué)科的知識，是一個多學(xué)科，多領(lǐng)域技術(shù)交叉，具有較強技術(shù)含量的系統(tǒng)。工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)是以工業(yè)化手段主動控制水環(huán)境。
工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖的特點：一是用水量少，可利用較低質(zhì)水源，對水資源要求較低；二是占地少，對土地資源的要求低；三是養(yǎng)殖密度高，單位耗水產(chǎn)量大；四是易于控制生長環(huán)境，魚類（以及其他養(yǎng)殖種類）生長速度快，生長周期短；五是飼料利用率高；六是水循環(huán)使用，利用系數(shù)高；七是排放的廢水廢物少，能集中處理，對環(huán)境無壓力或很小；八是不受外界氣候的影響，可實現(xiàn)常年生產(chǎn)。